[发明专利]用于快速筛查EGFR基因外显子18‑21突变的特异性引物及应用在审
申请号: | 201710873302.3 | 申请日: | 2017-09-25 |
公开(公告)号: | CN107419032A | 公开(公告)日: | 2017-12-01 |
发明(设计)人: | 曾瀚;其他发明人请求不公开姓名 | 申请(专利权)人: | 北京青航基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京智为时代知识产权代理事务所(普通合伙)11498 | 代理人: | 王加岭,杨静 |
地址: | 102600 北京市大兴区北京市经济技*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 快速 egfr 基因 外显子 18 21 突变 特异性 引物 应用 | ||
1.用于快速筛查EGFR基因外显子18-21突变的特异性引物,其特征在于,其核苷酸序列分别是:
EGFR外显子18正向引物:如SEQ ID No.1所示;
EGFR外显子18反向引物:如SEQ ID No.2所示;
EGFR外显子19正向引物:如SEQ ID No.3所示;
EGFR外显子19反向引物:如SEQ ID No.4所示;
EGFR外显子20正向引物:如SEQ ID No.5所示;
EGFR外显子20反向引物:如SEQ ID No.6所示;
EGFR外显子21正向引物:如SEQ ID No.7所示;
EGFR外显子21反向引物:如SEQ ID No.8所示。
2.权利要求1所述的特异性引物用于高分辨率熔解曲线分析联合触底PCR方法快速筛查EGFR基因外显子18-21突变。
3.一种快速筛查EGFR基因外显子18-21突变的检测方法,其特征在于,使用权利要求1所述的特异性引物,进行高分辨率熔解曲线分析联合触底PCR。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
(1)提取外周血样品基因组DNA;
(2)合成权利要求1所述的特异性引物共4对;
(3)使用上述引物对样品基因组DNA进行高分辨率熔解曲线分析联合触底PCR,95℃预变性10min,60℃15s,72℃15s,95℃10s,50个循环;95℃1min,40℃1min,从65℃开始,以0.02℃每秒的斜率采集熔解曲线,到95℃,之后40℃10s结束,用分析软件对采集后的曲线进行分析;
(4)HRM曲线分析:如相对于阴性对照出现了单独的峰,则为阳性结果,表明发生EGFR基因突变。
5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于:所述步骤(3)中PCR的反应体系是:
总体积为15μL的反应体系包含:master mix 10μL;MgCl2 2.4μL;GC enhancer 0.5μL;正向引物1μL;反向引物1μL,其余为RNase free H2O。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于:所述步骤(3)中向所述反应体系中依次加入样品基因组DNA 5μL、阴性对照、空白对照进行触底PCR反应。
7.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于:所述步骤(1)中外周血样品采用干血片收集。
8.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于:所述步骤(1)中样品基因组DNA的提取采用试剂盒提取。
9.权利要求1所述的特异性引物或权利要求4所述的检测方法在快速筛查EGFR基因突变检测试剂盒中的应用。
10.一种快速筛查EGFR基因外显子18-21突变的检测试剂盒,其特征在于:包含权利要求1所述的特异性引物,以及PCR试剂、阴性对照、空白对照。
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