[发明专利]基于DNA条形码的海水蟹类物种鉴别方法在审
申请号: | 201710879103.3 | 申请日: | 2017-09-26 |
公开(公告)号: | CN108330169A | 公开(公告)日: | 2018-07-27 |
发明(设计)人: | 胡则辉;柴学军;王跃斌;胡成硕 | 申请(专利权)人: | 浙江省海洋水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 嘉兴永航专利代理事务所(普通合伙) 33265 | 代理人: | 侯兰玉 |
地址: | 316021 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蟹类 物种鉴别 碱基序列 目的片段 条形码 引物 种蟹 海水 分子生物学鉴别 比对分析 核苷酸序 碱基数 物种 | ||
1.一种基于DNA条形码的海水蟹类物种鉴别方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:
(1)蟹类DNA提取;
(2)利用DNA条形码引物进行PCR扩增,扩增出217bp的产物,所述DNA条形码引物为CS217-F:GGACGATAAGACCCTATAAA;CF 217-R:ATTACGCTGTTATCCCTAAA;
(3)进行物种鉴别的序列特征比对,其中,是按下表所示的核苷酸序列特征变异的位点进行物种鉴别;
2.根据权利要求1所述的基于DNA条形码的海水蟹类物种鉴别方法,其特征在于:步骤(2)所述PCR扩增条件为:94℃预变性2min;94℃变性45s、50℃退火1min、72℃延伸1min,共35个循环;最后72℃延伸10min;反应体系为:12.5μL 2×Taq MasterMix、1μL上游引物(10μmol/L)、1μL下游引物(10μmol/L)、100ng模板DNA,用ddH2O将总体积补足至25μL。
3.一种DNA条形码引物,其特征在于:所述DNA条形码引物的核苷酸序列为:
CS 217-F:GGACGATAAGACCCTATAAA(SEQ ID NO:1);
CF 217-R:ATTACGCTGTTATCCCTAAA(SEQ ID NO:2)。
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