[发明专利]一种lncRNA在藏绵羊低氧适应性检测中的应用有效
| 申请号： | 201710885564.1 | 申请日： | 2017-09-27 |
| 公开（公告）号： | CN108330170B | 公开（公告）日： | 2019-02-19 |
| 发明（设计）人： | 刘建斌;丁学智;曾玉峰;郭宪;袁超;郭婷婷;孙晓萍;岳耀敬;梁春年;褚敏;冯瑞林;牛春娥;郭健;杨博辉 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人： | 刘奇 |
| 地址： | 730000 甘肃*** | 国省代码： | 甘肃;62 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 藏绵羊 低氧适应性 检测 应用 功能基因组学 适应性机制 反刍动物 低氧环境 分子生态 分子育种 极端环境 系统研究 表达谱 胁迫 筛选 支撑 研究 | ||
1.lncRNA在藏绵羊低氧适应性检测中的应用，其特征在于，所述lncRNA为TCONS_00332125、TCONS_00377466或TCONS_00139593；所述TCONS_00332125、TCONS_00377466和TCONS_00139593的序列分别如SEQ IDNO.1-3所示。
2.一种检测藏绵羊肝脏和肺脏组织中低氧适应性的试剂盒，其特征在于，包括以下组分：总RNA的反转录体系和cDNA的扩增体系；所述总RNA的反转录体系中包括总RNA，逆转录酶，dNTP和oligdT；所述cDNA的扩增体系中包括TCONS_00332125引物、TCONS_00377466引物和TCONS_00139593引物，所述TCONS_00332125引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4和SEQ IDNO.5所示，所述TCONS_00377466引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.7所示核苷酸序列，所述TCONS_00139593引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9所示；所述TCONS_00332125、TCONS_00377466和TCONS_00139593的序列如SEQ IDNO.1-3所示。
3.权利要求2所述试剂盒的使用方法，其特征在于，包括以下步骤：
提取待测组织样品总RNA；
利用所述总RNA反转录体系将提取的总RNA反转录制备成cDNA；
利用所述cDNA扩增体系，用所述TCONS_00332125引物、TCONS_00377466引物和TCONS_00139593引物对制备得到的cDNA进行qRT-PCR扩增lncRNA。
4.lncRNA在靶基因检测中的应用，其特征在于，所述lncRNA为TCONS_00332125、TCONS_00377466或TCONS_00139593，所述TCONS_00332125、TCONS_00377466和TCONS_00139593的序列分别如SEQ ID NO.1-3所示；所述低氧适应性靶基因的预测通过cis和trans作用方式实现；所述靶基因为ENSOARG00000007330、ENSOARG00000007403、ENSOARG00000007412、ENSOARG00000018872、ENSOARG00000007321、ENSOARG00000006342、ENSOARG00000006399、ENSOARG00000007219和ENSOARG00000000775。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000006342 qRT-PCR扩增引物为SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000006399 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.12和SEQ ID NO.13；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000007219 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.14和SEQ ID NO.15；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000007321 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.16和SEQ ID NO.17；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000007330 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.18和SEQ ID NO.19；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000007403 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.20和SEQ ID NO.21；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000007412 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.22和SEQ ID NO.23；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000018872 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.24和SEQ ID NO.25；
所述低氧适应性lncRNA的靶基因ENSOARG00000000775 qRT-PCR扩增引物为SEQ IDNO.26和SEQ ID NO.27。
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