[发明专利]一种lncRNA在藏绵羊低氧适应性检测中的应用有效

专利信息
申请号: 201710885564.1 申请日: 2017-09-27
公开(公告)号: CN108330170B 公开(公告)日: 2019-02-19
发明(设计)人: 刘建斌;丁学智;曾玉峰;郭宪;袁超;郭婷婷;孙晓萍;岳耀敬;梁春年;褚敏;冯瑞林;牛春娥;郭健;杨博辉 申请(专利权)人: 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 刘奇
地址: 730000 甘肃*** 国省代码: 甘肃;62
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摘要:
搜索关键词: 藏绵羊 低氧适应性 检测 应用 功能基因组学 适应性机制 反刍动物 低氧环境 分子生态 分子育种 极端环境 系统研究 表达谱 胁迫 筛选 支撑 研究
【说明书】:

发明提供了lncRNA在藏绵羊低氧适应性检测中的应用,所述lncRNA为TCONS_00332125、TCONS_00377466或TCONS_00139593,通过系统研究藏绵羊低氧适应性lncRNA表达谱,筛选经qRT‑PCR验证的与低氧适应性相关的lncRNA,能够应用于藏绵羊低氧适应性检测,有助于阐明藏绵羊对低氧环境胁迫下的适应性机制,丰富极端环境下反刍动物分子生态适应性方面的基础理论,且为藏绵羊分子育种及功能基因组学研究提供科学支撑。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域,具体涉及一种lncRNA在藏绵羊低氧适应性检测中的应用。

背景技术

青藏高原藏绵羊主要分为高原型(草地型)、山谷型和欧拉型三大类,各地根据其自然生态特点又细分为不同的类型,属粗毛型绵羊地方品种。藏绵羊原产于青藏高原,主要分布于西藏自治区及青海、甘肃、四川、云南、贵州等地,由于各生态条件差异悬殊,形成了不同的类型。高原型(草地型)藏绵羊是主体,数量最多,主要分布于西藏境内的冈底斯山、念青唐古拉山以北的藏北高原和雅鲁藏布江地带;山谷型藏绵羊主要分布在青海省南部的班玛、囊谦两县的部分地区,四川省阿坝藏族羌族自治州南部牧区,云南昭通市、曲靖市、丽江市及保山市腾冲县。欧拉型藏绵羊是一个特殊生态类型,中心产区位于甘肃省甘南藏族自治州玛曲县欧拉乡及比邻地区及青海省河南蒙古族自治县和久治县等地。

高寒和缺氧是高原地区主要的生态限制因子,高原土著动物在长期的适应进化过程中形成了独特的低氧适应策略(Liu et al.,2016;Wei et al.,2015;Beall,2013)。藏绵羊是青藏高原的土著反刍家畜和草地生态系统的重要组成部分,是藏族人民重要的生活和生产资料,同时也是其财富的象征(Long et al.,2008)。藏绵羊在粗放和传统的放牧管理模式下,千百年来对青藏高原严酷的生态环境具有极强的适应能力。藏绵羊经过长期的自然选择和进化,对高寒、低氧、强紫外线和冷季营养胁迫等恶劣的自然环境条件具有极强的适应能力,并通过生理和营养代谢加以调节。在对高海拔藏绵羊和低海拔小尾寒羊的肺组织结构研究中,发现藏绵羊单位面积肺泡数比小尾寒羊显著增多、肺泡隔的厚度显著增加、终末细支气管的管径显著减小,并认为这些差异和特点是藏绵羊肺组织适应高寒低氧的形态学特点(俞红贤,1999)。测定藏绵羊的肺动脉压、肺动脉楔压、体动脉压和心输出量、计算肺血管阻力,在NOS非选择性抑制剂的作用下,藏绵羊肺动脉压稍有增加,心输出量减少,且4500米比2300米处藏绵羊的肺血管阻力显著增大(P<0.05);在NOS选择性抑制物作用下,只有前者的肺血管阻力增加,后者没有变化。随内源性NOS活性受到抑制,NO的生成量亦减少,促使机体肺血管收缩,使藏绵羊适应低氧环境(Ruan et al.,2004)。这与Koizumi等对不同海拔藏绵羊的肺血管阻力的测定结果一致(Koizumi et al.,2004)。在慢性缺氧条件下,引进高海拔绵羊胎盘中的VEGF和NOS基因的表达量上调,机体通过合成VEGF来缓解低氧,这可能是低海拔绵羊在高海拔地区的长期习服机制(Parraguez et al.,2010)。在对高海拔藏绵羊和低海拔湖羊生化指标研究中,藏绵羊生化指标(红血细胞、红细胞压积、平均红细胞体积、红细胞平均血红蛋白)高或显著高,藏绵羊对高寒低氧的适应并不是从增加血红蛋白浓度上来实现的,可能是提高了血红蛋白输送氧气的能力和效率,这些独特的生理机能有利于增加肺通气量和肺血流量,并通过内源NO产量高低来调节肺部血管系统以适应高寒低氧的环境(Liu et al.,2016)。

藏绵羊不仅形成有效摄取、输送和利用氧的结构特征和生理机制,而且通过对细胞代谢和抗低氧因子诱导从分子水平上来适应高寒低氧环境(Wei et al.,2016;Yang etal.,2016;Liu et al.,2016)。这主要表现在一些细胞因子、淋巴因子、激素、能量代谢、氧传输、响应缺氧、DNA修复酶等一些适应性相关基因和信号通路的变化上;处于低氧环境中的组织细胞则可能通过其膜上的氧受体分子来感受低氧信号,并启动许多低氧反应基因做出复杂的响应(Wu,2012)。

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