[发明专利]一种鉴别石斛属植物的方法在审
申请号: | 201711002452.3 | 申请日: | 2017-10-24 |
公开(公告)号: | CN107604089A | 公开(公告)日: | 2018-01-19 |
发明(设计)人: | 陈军文;张敬丽;刘涛;蔡金龙;赵艳;谢世清;张广辉;范伟;杨生超 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 昆明正原专利商标代理有限公司53100 | 代理人: | 陈左,于洪 |
地址: | 650201 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 石斛 植物 方法 | ||
1.一种鉴别石斛属植物的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)对待鉴定样本进行总DNA提取;
(2)以步骤(1)提取的总DNA为模板,用SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物进行PCR扩增,获得扩增产物;
(3)使用CodonCode Aligner对扩增产物测序峰图进行校对拼接,去除低质量序列及引物区,用ClustalXv2.0进行多重序列比对后,去除俩端的多余序列,处理后的序列用于下一步的序列分析;使用Mega6.0软件计算序列的K-2-P距离,分析比较序列的种内种间遗传距离,并构建系统进化树,从而通过对不同种石斛的ITS序列的聚类来区分石斛物种。
2.根据权利要求1所述的鉴别石斛属植物的方法,其特征在于所述PCR 扩增的体系为:ddH2O 8.5μL,2×Taq PCR Master Mix 12.5μL,SEQ ID NO.1所示引物 2.5μmol/L 1μL,SEQ ID NO.2所示引物 2.5μmol/L 1μL,模板DNA 50ng/μL 2.0μL,总计25μL。
3.根据权利要求1所述的鉴别石斛属植物的方法,其特征在于所述PCR扩增的程序为:94℃预变性5min;然后进入循环,每个循环94℃变性50sec,54℃退火30 sec,72℃延伸60 sec,共30个热循环,最后延伸72℃延伸7min;4℃冷却后取出。
4.根据权利要求1所述的鉴别石斛属植物的方法,其特征在于,待鉴定样本叶片按照CTAB法提取总DNA,使用RNA酶A纯化总DNA样本后,用紫外分光光度计测定260nm和280nm下的光密度值,当测得DNA纯度达到OD260/OD280在1.6-1.8之间,则进行步骤(2)PCR反应,反之,则需要重新提取DNA。
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