[发明专利]一种鉴别中国沿岸鲬鱼未定种sp与刀鲬的分子标记引物及方法在审
申请号: | 201711013662.2 | 申请日: | 2017-10-26 |
公开(公告)号: | CN107557483A | 公开(公告)日: | 2018-01-09 |
发明(设计)人: | 杨天燕;陈治;高天翔 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙)33213 | 代理人: | 吴秉中 |
地址: | 316000 浙江省舟山市普陀海*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 中国 沿岸 未定 sp 分子 标记 引物 方法 | ||
1.一种鉴别中国沿岸鲬鱼未定种sp与刀鲬的分子标记引物,其特征在于:所述引物序列为:
Fish F1:5’-TCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC-3’;
Fish R2:5’-ACTTCAGGGTGACCGAAGAATCAGAA-3’。
2.一种鉴别中国沿岸鲬鱼未定种sp与刀鲬的分子标记方法,其特征在于:所述方法的具体步骤如下:提取鲬鱼未定种sp与刀鲬的DNA,以两种鱼的DNA为模板进行PCR扩增,对扩增结果进行纯化、测序,比对测序结果。
3.根据权利要求2所述的一种鉴别中国沿岸鲬鱼未定种sp与刀鲬的分子标记方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应体系组成为:超纯水17.5ul、10×buffer 2.5ul、dNTPs 2ul、rTaq 0.15ul、模板1ul、Primer各1ul。
4.根据权利要求2所述的一种鉴别中国沿岸鲬鱼未定种sp与刀鲬的分子标记方法,其特征在于:所述PCR扩增程序为:94℃预变性5min,然后94℃变性45s,50℃退火45s,72℃延伸45s,共进行35个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存∞。
5.根据权利要求2所述的一种鉴别中国沿岸鲬鱼未定种sp与刀鲬的分子标记方法,其特征在于:所述中国沿岸鲬鱼未定种sp的分子标记序列为:
TCTCTATCTAGTATTCGGTGCCTGAGCCGGAATGGTAGGCACTGCCCTAAGCCTGCTTATCCGGGCTGAACTCTGTCAGCCCGGCGCTTTACTGGGGGACGATCAAATCTATAACGTGATCGTTACAGCCCATGCCTTTGTAATAATTTTCTTTATAGTTATACCAATTATGATCGGGGGTTTCGGCAACTGGCTGGTCCCCCTAATGATTGGTGCACCAGACATGGCGTTTCCCCGAATAAACAACATAAGTTTTTGACTCTTACCTCCATCCTTCCTACTCCTTTTAGCCTCCTCAGCCGTAGAGGCTGGGGCAGGAACTGGTTGAACAGTCTACCCGCCCCTGTCAAGTAATCTTGCCCATGCAGGAGCCTCTGTTGACCTAACAATCTTTTCCCTCCATTTAGCAGGGATCTCTTCAATTCTTGGGGCCATCAACTTCATTACAACCATTATTAACATGAAACCTATTGCTATTACCCAATACCAAACACCCCTGTTTGTGTGATCCGTCCTAATTACGGCTGTTCTCCTTCTCCTCTCCCTGCCTGTGTTGGCTGCTGGCATTACAATGCTACTAACAGACCGAAATCTGAACACCACTTTCTTTGACCCTGCAGGAGGAGGGGACCCCATCCTGTACCAACACCTCTT;
刀鲬的分子标记序列为:
TCTCTATCTGGTATTCGGTGCCTGAGCCGGGATGGTAGGCACCGCCCTAAGCTTGCTCATCCGAGCCGAACTCAGCCAACCCGGCGCATTACTAGGAGACGATCAAATCTATAATGTGATCGTTACAGCCCATGCCTTTGTAATGATTTTCTTCATAGTTATACCAATTATAATTGGCGGCTTCGGCAACTGACTGGTCCCCCTAATAATTGGTGCGCCAGACATGGCGTTTCCCCGAATAAACAACATAAGTTTTTGACTCTTGCCTCCATCCTTCCTGCTCCTCCTAGCTTCCTCAGCCGTAGAAGGCGGGGCGGGCACCGGATGAACAGTCTACCCACCCCTGTCGAGCAACCTCGCCCATGCAGGGGCCTCTGTTGACCTAACAATTTTTTCCCTGCATTTAGCAGGAATCTCTTCAATTCTTGGAGCCATCAACTTCATCACAACCATTATTAACATGAAACCTATTGCTATTACTCAGTACCAAACACCCCTGTTKGTGTGGTCCGTCCTAATTACGGCTGTTCTCCTTCTTCTATCCCTGCCTGTTCTGGCTGCTGGTATCACAATGCTACTAACAGACCGAAATCTAAACACCACTTTCTTTGACCCTGCAGGAGGAGGAGACCCAATCTTATATCAACACCTCTT。
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