[发明专利]一种快速检测茶树炭疽病菌的LAMP引物及检测方法有效
申请号: | 201711015122.8 | 申请日: | 2017-10-26 |
公开(公告)号: | CN107760795B | 公开(公告)日: | 2021-04-20 |
发明(设计)人: | 兰成忠;游泳;阮宏椿;吴玮;姚锦爱 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350013 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 茶树 炭疽 病菌 lamp 引物 方法 | ||
1. 一种快速检测茶树炭疽病菌的LAMP引物,其特征在于,所述的引物为外引物F3、B3和内引物FIP、BIP,其引物的核酸序列分别为:F3: 5’- CCGTCAATCATCGACCTCCT-3’,B3:5’- TCTCGTCACGTACCAGAAGG -3’,FIP: 5’- CTTACGCACTGGCCGGTCTG-GGAATGTTTTGCTGACTGCG-3’,BIP: 5’- CCGAGTCAAATCCAACCGCCT-GCACCAATCTGGTTACCCTG-3’。
2.一种LAMP法检测茶树炭疽病菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测样品基因组DNA:采用CTAB法或用市售的DNA提取试剂盒,按操作步骤提取待测样品中DNA;
(2)LAMP反应体系的建立:以步骤(1)提取的DNA为模板,利用权利要求1所述的外引物F3、B3和内引物FIP、BIP进行LAMP扩增,LAMP检测反应体系为25 μL,在200 μLPCR管中加入下列试剂:5 μM外引物F3和B3各1.0 μL,40 μM内引物FIP和BIP各1.0 μL,LAMP反应混合液12.5μL,8 U
(3)LAMP反应条件:将配制好反应体系的PCR管于63℃水浴锅中恒温反应60 min,然后80℃下反应5 min 终止反应;
(4)反应结果的测定:采用荧光染料目测观察法,待LAMP反应结束后,在LAMP反应的扩增产物中加入显色剂SYBR greenⅠ1.0 μL,静置5min进行显色观察,在常光下观察到绿色荧光的判断为阳性,存在茶树炭疽病菌,橙色或橘黄色判断为阴性,不存在茶树炭疽病菌,在紫外光下若观察到浑浊状沉淀则判断为阳性,存在茶树炭疽病菌,澄清透明则判断为阴性,不存在茶树炭疽病菌。
3. 根据权利要求2所述的一种LAMP法检测茶树炭疽病菌的方法,其特征在于,LAMP反应混合液由以下组分组成:40 mM Tris-HCl,20 mM (NH4)2SO4,20 mM KCl,16 mM MgSO4,1.6 mol/L甜菜碱,2.0 mM dNTPs,0.2wt.% Trion X-100。
4.如权利要求1所述的引物在茶树炭疽病的早期诊断和病菌的监测、鉴定上的应用。
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