[发明专利]用于检测EGFR基因19外显子缺失突变的引物组、试剂盒及方法在审
申请号: | 201711015221.6 | 申请日: | 2017-10-25 |
公开(公告)号: | CN107574233A | 公开(公告)日: | 2018-01-12 |
发明(设计)人: | 张戈;滕祥云;黄少亚 | 申请(专利权)人: | 长沙三济生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
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地址: | 410205 湖南省长沙市高新开*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 egfr 基因 19 外显子 缺失 突变 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测EGFR基因19外显子缺失突变的引物组,其特征在于,所述引物组包括扩增引物对、探针及PNA,其中:
所述扩增引物对序列如下:
正向引物:5’-TCCCAGAAGGTGAGAAAGT-3’;
反向引物:5’-GGATTTCCTTGTTGGCTTT-3’;
所述探针序列为:FAM-5’-ATTCCCGTCGCTATC-3’-MGB;
所述PNA序列为:
NH2-5’-GATGTTGCTTCTCTTAATTCC-3’-COOH。
2.一种用于检测EGFR基因19外显子缺失突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括两套PCR反应体系,第一套PCR反应体系包括针对EGFR基因19外显子野生型和缺失突变检测设计的扩增引物对及探针,其中:
所述扩增引物对序列如下:
正向引物:5’-TCCCAGAAGGTGAGAAAGT-3’;
反向引物:5’-GGATTTCCTTGTTGGCTTT-3’;
所述探针序列为:FAM-5’-ATTCCCGTCGCTATC-3’-MGB;
所述第一套PCR反应体系还包括2×PCRbuffer、DNA模板和去离子水;
第二套PCR反应体系包括针对EGFR基因19外显子缺失突变检测设计的扩增引物对、探针及PNA,其中:
所述扩增引物对序列如下:
正向引物:5’-TCCCAGAAGGTGAGAAAGT-3’;
反向引物:5’-GGATTTCCTTGTTGGCTTT-3’;
所述探针序列为:FAM-5’-ATTCCCGTCGCTATC-3’-MGB;
所述PNA序列为:
NH2-5’-GATGTTGCTTCTCTTAATTCC-3’-COOH;
所述第二套PCR反应体系还包括2×PCRbuffer、DNA模板和去离子水。
3.根据权利要求2所述的用于检测EGFR基因19外显子缺失突变的试剂盒,其特征在于,所述第一套PCR反应体系的成分终浓度为:1×PCR buffer、0.2μM正向引物、0.2μM反向引物、0.2μM探针和1μL DNA模板。
4.根据权利要求3所述的用于检测EGFR基因19外显子缺失突变的试剂盒,其特征在于,所述第二套PCR反应体系的成分终浓度为:1×PCR buffer、0.2μM正向引物、0.2μM反向引物、0.2μM探针、2μM PNA和1μL DNA模板。
5.根据权利要求2至4任一项所述的用于检测EGFR基因19外显子缺失突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性对照品、阴性对照品和空白对照品。
6.根据权利要求5所述的用于检测EGFR基因19外显子缺失突变的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照品为EGFR基因突变型质粒,所述阴性对照品为EGFR基因野生型质粒,所述空白对照品为无核酸酶水。
7.一种检测EGFR基因19外显子缺失突变的方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一:取待检测样本抽提的DNA,作为PCR模板;
步骤二:提供如权利要求6所述的试剂盒,取出适量第一套PCR反应体系和第二套PCR反应体系,将适量PCR模板分别与第一套PCR反应体系和第二套PCR反应体系分别混匀;
步骤三:两套PCR反应体系均进行PCR扩增反应:95℃预变性5min;45cycles,95℃15sec,58℃30sec;
步骤四:PCR结果判定:在所述试剂盒的阳性对照品、阴性对照器和空白对照品符合规定的情况下,根据荧光扩增曲线得到两套PCR反应体系的CT值及其差值定性判断EGFR基因19外显子缺失突变。
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