[发明专利]一种提取板蓝根干样基因组DNA的方法在审
申请号: | 201711017592.8 | 申请日: | 2017-10-26 |
公开(公告)号: | CN107586773A | 公开(公告)日: | 2018-01-16 |
发明(设计)人: | 邹志文;许睿;夏斌;辛天蓉;王静;奚剑飞 | 申请(专利权)人: | 南昌大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 南昌新天下专利商标代理有限公司36115 | 代理人: | 施秀瑾 |
地址: | 330031 江西省*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提取 板蓝根 基因组 dna 方法 | ||
技术领域
本发明属于DNA提取技术领域,涉及板蓝根基因组DNA的提取方式。
背景技术
板蓝根为十字花科二年生草本植物菘蓝Isatis indigotica Fort.的干燥根,是传统的名贵中药材之一,具有清热、解毒、凉血消肿、利咽之功效,是我国近年来治疗感冒的常用药材。目前市售南板蓝根常见混有球花马蓝、少花马蓝等伪劣品,且部分地区出现误用或混用马鞭草科路边青等现象,严重影响了板蓝根的临床应用及其中成药的质量。
随着分子生物学的快速发展,利用基因组DNA检测药物的真伪已进入实际应用,高效地提取药用植物基因组DNA可以有效降低该方法的应用成本。植物板蓝根干样中含多糖、蛋白质、多酚或其它不易去除的杂质,目前使用的CTAB(Cetyltrimethyl Ammonium Bromide)法大多针对提取板蓝根鲜样,而针对市售的板蓝根干样,目前的方法提取的基因组DNA得率低,成功率低且所得DNA质量较差,严重影响了 PCR 反应及分子鉴定等后续的工作。
发明内容
本发明的目的在于提供一种提取板蓝根干样基因组DNA的方法,以解决现有技术提取板蓝根干样基因组DNA效果不佳的问题。
本发明是通过以下技术方案实现的。
本发明所述的一种提取板蓝根干样基因组DNA的方法,其步骤如下。
(1)取去除表皮的板蓝根干样组织0.05~0.1 g,使用液氮在研钵中研磨成粉末,在组织解冻前转移到1.5mL离心管中。
(2)加入500~750 μL的 2%的CTAB(Cetyltrimethyl Ammonium Bromide)溶液,颠倒混匀后在65℃水浴2~3 h,期间要上下颠倒混匀数次。
(3)取出离心管,加入与步骤(2)等体积的按24:1体积比混合的三氯甲烷与异戊醇的混合液,上下颠倒充分混合,晃动数次。
(4)4℃条件下14000 rpm 离心15min。
(5)用移液枪吸取管中上层水相。
(6)在抽提出的水相中加入与等体积4℃下预冷的异丙醇,轻轻晃动混匀后在-20 ℃沉淀6~12小时。
(7)4℃条件下14000 rpm 离心15min,去上清,倒置于吸水纸上控干。
(8)加入与步骤(2)等体积的无水乙醇,上下颠倒数次,洗涤沉淀,4℃条件下12000 rpm离心10min离心,去上清,倒置于吸水纸上控干。
(9)重复步骤(8)两遍。
(10)将步骤(9)所得沉淀置于超净工作台中吹干。
(11)在离心管中加入30~50 μL的灭菌去离子水或者TE缓冲液(Tris-EDTA buffer solution),4℃放置4~6小时。
(12)-20℃或-80℃低温保存。
采用本发明的方法提取干样板蓝根组织基因组DNA,其所用试剂易得,成功率高且所得DNA质量较好,有利于PCR反应及分子鉴定等后续的工作。
具体实施方式
本发明将通过以下实施例作进一步说明。
实施例1。
(1)称取去除表皮的板蓝根干样组织0.1g,迅速使用液氮在研钵中将其研磨成粉末,在组织解冻前转移到1.5mL离心管中。
(2)加750 μL 的2% CTAB,颠倒混匀后在65℃水浴3 h,期间要上下颠倒混匀数次。
(3)取出离心管,加入等体积的24:1 (三氯甲烷:异戊醇)混合液,上下颠倒充分混合,晃动5 min。
(4)4℃条件下14000 rpm 离心15min,将离心管动作轻缓的取出转子,放置于离心架上。
(5)用移液枪吸取管中上层水相。
(6)在抽提出的水相中加入等体积4℃预冷的异丙醇,轻轻晃动混匀后在-20℃沉淀6小时。
(7)在4℃条件下14000 rpm离心15 min,去上清,倒置于吸水纸上控干。
(8)加入适量700 μL 70%酒精,上下颠倒数次,4℃条件下12000 rpm离心10min,倒置于吸水纸上控干。
(9)重复步骤(8)两遍。
(10)将步骤(9)所得沉淀置于超净工作台中吹干。
(11)在离心管中加入50 μL的灭菌去离子水或者TE缓冲液,4 ℃放置4小时。
(12)-80℃低温保存。
实施例2。
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