[发明专利]同时检测腐烂病菌、黄化病植原体和丛簇病菌的核酸、试剂盒及方法有效
申请号: | 201711051039.6 | 申请日: | 2017-10-31 |
公开(公告)号: | CN107604091B | 公开(公告)日: | 2019-11-08 |
发明(设计)人: | 李伟;张翠萍 | 申请(专利权)人: | 青岛农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京易捷胜知识产权代理事务所(普通合伙) 11613 | 代理人: | 齐胜杰 |
地址: | 266109 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 检测 腐烂 病菌 黄化 原体 核酸 试剂盒 方法 | ||
1.一组用于多重PCR同时检测三种病原的核酸,其特征在于,包括用于检测腐烂病菌、黄化病植原体和丛簇病菌的上、下游引物,其中,所述腐烂病菌的上游引物序列如SEQ IDNo.1所示,下游引物序列如SEQ ID No.2所示;
所述黄化病植原体的上游引物序列如SEQ ID No.4所示,下游引物序列如SEQ ID No.5所示;
所述丛簇病菌的上游引物序列如SEQ ID No.7所示,下游引物序列如SEQ ID No.8所示。
2.一组用于荧光定量PCR同时检测三种病原的核酸,其特征在于,包括如权利要求1中所述的用于检测腐烂病菌、黄化病植原体和丛簇病菌的上、下游引物及各病原体对应的探针,
所述腐烂病菌的探针序列如SEQ ID No.3所示;
所述黄化病植原体的探针序列如SEQ ID No.6所示;
所述丛簇病菌的探针序列如SEQ ID No.9所示。
3.如权利要求1或2所述的核酸,其特征在于,该组核酸还包括检测腐烂病菌、黄化病植原体和丛簇病菌的阳性扩增产物,其中,
所述检测腐烂病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.10中第21-197bp所示的序列;
所述检测黄化病植原体的阳性扩增产物如SEQ ID No.11中第17-106bp所示的序列;
所述检测丛簇病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.12中第20-219bp所示的序列。
4.一种用于荧光定量PCR同时检测三种病原的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括:如权利要求2中所述的用于检测腐烂病菌、黄化病植原体和丛簇病菌的三种病原的上、下游引物和相应的探针,各条探针的5'端和3'端分别标记TEXRED-BHQ2、FAM-TAMRA和CY5-BHQ3。
5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,还包括检测腐烂病菌、黄化病植原体和丛簇病菌的三种病原的阳性扩增产物,其中,
所述检测腐烂病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.10中第21-197bp所示的序列;
所述检测黄化病植原体的阳性扩增产物如SEQ ID No.11中第17-106bp所示的序列;
所述检测丛簇病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.12中第20-219bp所示的序列。
6.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,还包括Premix EX Taq×2。
7.一种用于荧光定量PCR同时检测三种病原的检测方法,其特征在于,该方法用于检测腐烂病菌、黄化病植原体和丛簇病菌的三种病原,具体包括以下步骤:
(1)从样品中提取DNA;
(2)对提取的所述DNA进行荧光定量PCR扩增;其中,荧光定量PCR扩增时,在反应体系中,采用所述腐烂病菌的上、下游引物和探针的核苷酸序列如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示,其探针5'端和3'端分别对应标记TEXRED和BHQ2;所述黄化病植原体的上、下游引物和探针的核苷酸序列如SEQ ID No.4、SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示,其探针5'端和3'端分别对应标记FAM和TAMRA;所述丛簇病菌的上、下游引物和探针的核苷酸序列如SEQ ID No.7、SEQ ID No.8和SEQ ID No.9所示,其探针5'端和3'端分别对应标记CY5和BHQ3;
(3)收集荧光信号,选择步骤(2)中的荧光基团的荧光检测模式,基线调整取3~15个循环的荧光信号,以阈值线刚好超过正常阴性对照的最高点设定阈值线;
(4)结果判定:待测样品荧光增长曲线超过阈值线,并呈现良好的对数增长,则判断为阳性,如无典型的扩增曲线,判断为阴性。
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