[发明专利]一种牛巴贝斯虫巢式PCR特异性引物及检测试剂盒与巢式PCR检测方法在审
申请号: | 201711055046.3 | 申请日: | 2017-11-01 |
公开(公告)号: | CN107653333A | 公开(公告)日: | 2018-02-02 |
发明(设计)人: | 王素华;吴绍强;帅江冰;袁淑辉;杜爱芳;吕继洲;张晓峰 | 申请(专利权)人: | 王素华 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/6848;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 温州金瓯专利事务所(普通合伙)33237 | 代理人: | 王坚强 |
地址: | 325000 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种牛 巴贝斯虫巢式 pcr 特异性 引物 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种牛巴贝斯虫巢式PCR特异性引物,其特征在于,包括设计的两对特异性引物,具体为:
引物F1: 5'-CGA-GGA-AGG-AAC-TAC-CGA-TG-3';
引物R1: 5'-GCA-TAA-CGA-CGT-GCA-AAC-TT-3'`;
引物F2: 5'-ACC-GAT-GTT-GAA-TAT-CTT-G-3';
引物R2: 5'-CTT-GGA-AAG-AGT-TGG-AAT-CT-3'。
2.一种牛巴贝斯虫巢式PCR检测试剂盒,其特征在于,所述的巢式PCR检测试剂盒包括以下组分:
(一)权利要求1所述的两对特异性引物;
(二)阳性对照:所述的阳性对照为含有目的基因片段的重组质粒,该质粒含牛巴贝斯虫1092bp基因片段;
(三)阴性对照:所述的阴性对照为去离子水;
(四)Taq酶。
3.根据权利要求2所述的牛巴贝斯虫巢式PCR检测试剂盒,其特征在于,所述的阳性对照通过将扩增产物克隆至pUCm-T转化DH5-α感受态细胞, 经酶切鉴定及测序后获得为阳性重组质粒的阳性对照。
4.一种采用权利要求1所述的特异性引物的牛巴贝斯虫巢式PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)被检标本DNA提取:取微小牛蜱数只,酒精清洗,每只微小牛蜱放入单独的1.5ml EP dof管,200μL PBS液浸没微小牛蜱,用样品破碎仪破碎蜱的虫体,吸取破碎后的溶液,加入Trizol试剂裂解,采用常规的酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,干燥后用三羟甲基氨基甲烷-乙二胺四乙酸溶解,-20℃保存备用;
(2)以权利要求1中的外引物F1、R1扩增:在EP dof管中加入处理后的微小牛蜱标本DNA,同时设阴、阳性对照,10×PCR Buffer,Mgcl2,dNTP,Taq酶,25pmol/μL F1,25pmol/μL R1,DNA模板,ddH2O混匀后稍离心的50μL反应体系中进行第一轮PCR;
(3)以权利要求1中的内引物F2、R2扩增:以第一轮PCR产物DNA为模板,以F2、R2为第二套引物,在10×PCR Buffer,Mgcl2,dNTP,Taq酶,25pmol/μL F2,25pmol/μL R2,DNA模板,ddH2O混匀后稍离心的50μL反应体系进行第二轮PCR;
(4)PCR产物鉴定:取第二轮PCR产物2μL进行1.5%琼脂糖凝胶电泳鉴定;
(5)测序:将第二轮PCR产物送测序公司进行序列测定。
5.根据权利要求4所述的牛巴贝斯虫巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(2)中的第一轮PCR反应条件为:
95℃预热5min ;
95℃保持30s,55℃保持1min,72℃保持1min,该步骤进行共30个循环;
末次延伸至72℃,保持10min。
6.根据权利要求4所述的牛巴贝斯虫巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(2)中的第二轮PCR反应条件为:
95℃预热5min ;
95℃保持30s,55℃保持1min,72℃保持1min,该步骤进行共30个循环;
末次延伸至72℃,保持10min。
7.根据权利要求4所述的牛巴贝斯虫巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(2)中第一轮PCR50μL反应体系中微小牛蜱样品基因组DNA模板量为5μl,10×PCR Buffer 为5μL,Mgcl2为2μL,dNTP为4μL,Taq酶为0.5μL,25pmol/μL F1为 1μL,25pmol/μL R1 为1μL, ddH2O 为31.5μL。
8.根据权利要求4所述的牛巴贝斯虫巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(4)中第二轮PCR50μL反应体系中第一轮PCR产物DNA模板量为2μl, 10×PCR Buffer为5μL,Mgcl2为2μL,dNTP为4μL,Taq酶为0.5μL,25pmol/μL F2 1μL,25pmol/μL R2为1μL, ddH2O为34.5μL。
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