[发明专利]一种快速鉴别飞虱种类的多重PCR试剂盒及其鉴别方法在审
申请号: | 201711065591.0 | 申请日: | 2017-11-02 |
公开(公告)号: | CN107653330A | 公开(公告)日: | 2018-02-02 |
发明(设计)人: | 刘淑华;唐健;刘瑞;罗举;王爱英;杨保军 | 申请(专利权)人: | 中国水稻研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙)33213 | 代理人: | 张晓红 |
地址: | 311499 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴别 种类 多重 pcr 试剂盒 及其 鉴别方法 | ||
技术领域
本发明属于分子生物学鉴别技术领域,具体涉及一种快速鉴别飞虱种类的多重PCR试剂盒及其鉴别方法。
背景技术
褐飞虱[Nilaparvata lugens (Stål)]是亚洲稻区最严重的水稻害虫之一,具远距离迁飞习性。准确的虫情预测预报是害虫防治的关键,目前主要采用灯诱监测。测报灯下褐飞虱的始见日、迁入量、迁入峰是褐飞虱预测预报的重要依据,也是褐飞虱防治策略制定的关键信息依据。
拟褐飞虱[Nilaparvata bakeri (Muir)]和伪褐飞虱[Nilaparvata muiri China]是褐飞虱的同属近似种,并不以水稻为适宜寄主。拟褐飞虱、伪褐飞虱与褐飞虱具有广泛的共同分布区域,发生季节也有交叉,且都具有趋光性,对预测预报的准确性造成了严重影响。褐飞虱、拟褐飞虱和伪褐飞虱形态非常相似,肉眼难以区分,需专业植保人员借助于显微镜才能鉴别区分,耗时费力,且不能鉴别残缺的飞虱个体。
聚合酶链式反应(PCR)技术以其高敏感性、高特异性等特点,被广泛应用于昆虫学领域,如系统进化树的构建等。多重PCR是在常规PCR基础上改进并发展起来的一种新型DNA扩增技术,是在同一反应体系中同时加入多对引物扩增多条DNA片段,采用这一技术可实现多种昆虫种类的同步鉴别。但多重PCR检测的准确性受多种因素的影响,比如DNA聚合酶的活性、引物的特异性、PCR反应条件,不同样本对试剂的竞争等。
昆虫核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacer, ITS)具有进化速率快,物种间差异较大而物种内比较保守,拷贝数多的特点,被广泛应用于物种鉴别。崔亚丽等(2012年)曾利用ITS区设计引物,以DNA为模板,初步建立了褐飞虱、拟褐飞虱和伪褐飞虱的多重PCR检测技术,但具有耗时长、耗费大的缺点,且多重和单重引物对扩增条带长度有一定差异。基于当前现状,迫切需要建立一种快速、简便、经济的分子生物学鉴定方法。
发明内容
针对现有技术中存在的上述问题,本发明的目的在于提供一种快速鉴别飞虱种类的多重PCR试剂盒及其鉴别方法的技术方案,其针对三种飞虱的ITS序列,在验证ITS区序列的基础上,设计并优化了引物对及配比,以粗组织样品为模板,节省了提取DNA的所耗费的时间和试剂,建立了更加快速、准确、灵敏、高通量、低成本地鉴别三种飞虱的多重PCR检测试剂盒及鉴别方法,为分子生物学方法鉴别褐飞虱、拟褐飞虱和伪褐飞虱提供选择。
所述的一种快速鉴别飞虱种类的多重PCR试剂盒,其特征在于包括: 1)3条上游引物和3条下游引物; 2)阳性对照重组质粒模板; 3)PCR反应液;其中,所述的3条上游引物和3条下游引物序列分别为:
扩增褐飞虱的特异性引物的核苷酸序列为:
Nl-F: 5’- CAACTAGGTAAGTAAAGGTGCTAC -3’
Nl-R: 5’- GCTTGCTGTTAAGTCACAAG -3’
扩增拟褐飞虱的特异性引物的核苷酸序列为:
Nb-F: 5’- GCTAGTCATTACATTGTATGTTGG -3’
Nb-R: 5’- ACTTTCTGGTCCGACTAACAT -3’
扩增伪褐飞虱的特异性引物的核苷酸序列为:
Nm-F: 5’- TGTATGATGGCAGCATTAATCT -3’
Nm-R: 5’- GAAATTTGTATGGTTCAATGTGTAG -3’。
所述的一种快速鉴别飞虱种类的多重PCR试剂盒,其特征在于其中所述的阳性对照为:分别含褐飞虱ITS1、拟褐飞虱ITS1、伪褐飞虱IST2区核苷酸序列的重组质粒标准品;
褐飞虱IST1序列 (595 bp):
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