[发明专利]一种基于高通量测序的双歧杆菌快速检测方法及应用有效
| 申请号： | 201711111254.0 | 申请日： | 2017-11-13 |
| 公开（公告）号： | CN107653306B | 公开（公告）日： | 2020-05-08 |
| 发明（设计）人： | 陈卫;陆文伟;胡陆军;翟齐啸;赵建新;张灏 | 申请（专利权）人： | 江南大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12Q1/06 |
| 代理公司： | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人： | 张勇 |
| 地址： | 214122 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 基于 通量 杆菌 快速 检测 方法 应用 | ||
1.一种鉴定双歧杆菌的方法，其特征在于，以groEL基因为标记物，以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，扩增获得标记物基因片段的菌株为双歧杆菌，所述标记物基因片段的大小为400～600bp。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述扩增是对含有微生物基因组的对象进行扩增。
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述对象包括基因组DNA、菌悬液或单菌落。
4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述扩增是以含待测混合物的基因组DNA为模板进行扩增。
5.一种鉴定复杂样品中双歧杆菌亚种组成的方法，其特征在于，所述方法包括：(1)构建双歧杆菌groEL基因数据库；(2)以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，对复杂样品基因组中groEL基因序列进行扩增；(3)将扩增结果回收、建库、测序；(4)将测序结果与双歧杆菌groEL基因数据库比对，鉴定双歧杆菌亚种；所述双歧杆菌groEL基因数据库含有Genbank数据库中可检索到的groEL基因序列。
6.一种筛选双歧杆菌的方法，其特征在于，将待筛选的样品制成菌悬液，稀释、涂布于固体培养基上，培养至形成单菌落，再以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，对groEL基因的序列进行扩增，扩增获得大小为400～600bp基因片段的菌株为双歧杆菌。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述固体培养基包括MRS培养基、BS培养基或BBL培养基。
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