[发明专利]一种用于HER-2基因拷贝数扩增检测的核酸序列、试剂盒及其应用有效
申请号: | 201711138769.X | 申请日: | 2017-11-16 |
公开(公告)号: | CN107739760B | 公开(公告)日: | 2019-11-05 |
发明(设计)人: | 任绪义;虞闰六;宣文静;周磊;罗英 | 申请(专利权)人: | 杭州迪安医学检验中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人: | 陈娟 |
地址: | 310030 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 扩增 人表皮生长因子受体 核酸序列 试剂盒 基因 分子诊断技术 诊断和治疗 参考依据 基因扩增 检测试剂 快速检测 扩增检测 特异性强 数字PCR 高通量 拷贝数 可用 探针 微滴 引物 灵敏 应用 | ||
1.一种用于检测HER-2基因扩增的核酸序列,其特征在于,包括如下引物对及探针:
(1)扩增HER-2基因扩增的引物序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1~2所示;
(2)扩增HER-2基因的探针序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
(3)扩增21-TFF3-S基因的引物序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO:4~5所示;
(4)扩增21-TFF3基因的探针序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示;
(5)扩增21-TFF3-L基因的引物序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO:7~8所示;
其中,HER-2探针SEQ ID NO:3序列的5’端标记FAM荧光基团,3’端标记MGB淬灭基团,21-TFF3基因探针SEQ ID NO:6序列的5’端标记VIC荧光基团,3’端标记MGB淬灭基团,上述8条核酸序列在一次2孔检测中使用。
2.一种用于检测HER-2基因扩增的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括如下试剂:
(1)2*supermix:该PCR反应液中含有DNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液、dATP、dCTP、dTTP和dGTP等;
(2)引物探针预混合液:将SEQ ID NO:1~8所示的引物及探针各自用双蒸水溶解,每条引物的浓度为100μM,每条探针的浓度为10μM;SEQ ID NO:1~3各核酸序列的母液以9:9:25的比例混合;SEQ ID NO:4~6各核酸序列的母液以9:9:25的比例混合;SEQ ID NO:6~8各核酸序列的母液以25:9:9的比例混合,最终形成引物/探针在反应体系中的浓度为900/250nM;
(3)阳性对照:FISH检测为HER-2基因簇状扩增的福尔马林浸泡的石蜡组织样本FFPE;
(4)阴性对照:FISH检测为HER-2基因不扩增的福尔马林浸泡的石蜡组织样本FFPE。
3.根据权利要求2所述用于检测HER-2基因扩增的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照中,HER-2基因拷贝数/人21-TFF3-S基因拷贝数RS≥1.8,HER-2基因拷贝数/人21-TFF3-L基因拷贝数RL≥2.5。
4.根据权利要求2所述检测HER-2基因扩增的试剂盒,其特征在于,所述阴性对照中,HER-2基因拷贝数/人21-TFF3-S基因拷贝数RS<1.8,HER-2基因拷贝数/人21-TFF3-L基因拷贝数RL<2.5。
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