[发明专利]一种检测肉牛PLAG1基因Indel标记的方法及其专用试剂盒

权利要求书

1.一种检测郏县红牛PLAG1基因Indel标记的方法，其特征在于：包括以下步骤：

以郏县红牛的基因组DNA为模板，以引物对P1为引物，PCR扩增获得包含插入/缺失位点的郏县红牛PLAG1基因部分片段，然后进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果将不同肉牛个体分为缺失型、正常型或杂合型；

所述的引物对P1为：

上游引物F1：5'-TCCGAACAACAGGTGAGGGAGAAAT-3'

下游引物R1：5'-CCACTTCAGGGGTGCTCTAGGTTTG-3'；

所述的正常型在琼脂糖凝胶电泳结果中表现为142bp的一条条带；杂合型表现为142bp和123bp的两条条带；缺失型表现为123bp的一条条带；

在郏县红牛中，正常型或杂合型的个体比缺失型个体在生长性状上更优。

2.根据权利要求1所述一种检测郏县红牛PLAG1基因Indel标记的方法，其特征在于：所述的插入/缺失位点位于牛PLAG1基因参考序列AC 000171.1的25020872-25020890位。

3.根据权利要求1所述一种检测郏县红牛PLAG1基因Indel标记的方法，其特征在于：所述的PCR扩增采用的反应体系包括10ng/μL模板DNA 1μL及10μmol/L的引物对P1所对应的上、下游引物各0.5μL。

4.根据权利要求1所述一种检测郏县红牛PLAG1基因Indel标记的方法，其特征在于：所述的PCR扩增采用的反应程序为：1)95℃预变性5min；2)95℃变性30s，63℃退火30s，72℃延伸20s，共35个循环；3)72℃延伸10min。

5.根据权利要求1所述一种检测郏县红牛PLAG1基因Indel标记的方法，其特征在于：所述的琼脂糖凝胶的质量浓度为3％。

6.如权利要求1所述的检测郏县红牛PLAG1基因Indel标记的方法在肉牛分子标记辅助选择育种中的应用。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于：在郏县红牛中，正常型或杂合型的个体比缺失型个体在生长性状上更优。

8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于：所述的生长性状为尻长、腰角宽、胸深、坐骨端宽、胸围或荐高。

9.一种检测郏县红牛PLAG1基因Indel标记的试剂盒，其特征在于：包括用于PCR扩增肉牛插入/缺失位点的引物对P1，所述的引物对P1为：

上游引物F1：5'-TCCGAACAACAGGTGAGGGAGAAAT-3'

下游引物R1：5'-CCACTTCAGGGGTGCTCTAGGTTTG-3'。