[发明专利]一种CYP2C19基因的快速扩增试剂盒及扩增方法在审
申请号: | 201711267084.5 | 申请日: | 2017-12-05 |
公开(公告)号: | CN109868306A | 公开(公告)日: | 2019-06-11 |
发明(设计)人: | 不公告发明人 | 申请(专利权)人: | 新开源鸿辉(广州)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 510145 广东省广州市荔*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 扩增 扩增试剂盒 扩增引物 试剂盒 引物特异性 扩增产物 扩增效率 灵活选择 一盒多用 多重PCR 对引物 缓冲液 错配 位点 引物 条目 检测 | ||
本发明公开了一种CYP2C19基因的快速扩增试剂盒及扩增方法,其中试剂盒内包括三对扩增引物、Taq酶、dNTPs和缓冲液,其中扩增引物用于扩增CYP2C19*2型、CYP2C19*3型和CYP2C19*17型中的至少两个SNP位点,每对引物分别对应其中一个SNP位点的上下游区域。本发明采用多重PCR的扩增方法,同时扩增CYP2C19的多个重要SNP位点,且可以根据实际需要灵活选择扩增的位点组合,可以起到一盒多用的作用,试剂盒中的引物特异性高,错配率低,引物长度和Tm值设计合理,扩增产物便于检测分离。一次扩增多条目的产物,不仅大大提高了扩增效率,降低了扩增成本。
技术领域
本发明涉及一种CYP2C19基因的快速扩增试剂盒及扩增方法,属于生物领域,尤其是生物检测领域。
背景技术
药物代谢酶在药物体内代谢过程中起着重要作用,其活性高低直接决定药物作用的强度和持久性。细胞色素P450(CYP450)是人体内的药物代谢主要的酶,参与了40%~50%上市药物代谢,其活性强弱是决定药物代谢速率的重要因素。
CYP2C19酶称为S-美芬妥英-4-羟化酶,是细胞色素P450家族(CYP450)最重要的药物代谢酶之一,CYP2C19的基因多态性影响着氯吡格雷、奥美拉唑、苯妥英钠和地西泮等许多药物的代谢。CYP2C19酶位于肝微粒体内,其编码基因位于人类10号染色体q24.1-24.3位点,野生型为CYP2C19*1/*1型,具有正常酶活性,。但中国人群中常有基因突变,常见突变类型是CYP2C19*2型(第5外显子G681A)和CYP2C19*3型(第4外显子G636A)。CYP2C19*2型和CYP2C19*3型可引起CYP2C19基因编码的酶活性丧失,代谢底物的能力减弱,使血药浓度增高,在常规治疗剂量时易引起蓄积中毒。中国人群中的弱代谢者99%为CYP2C19*2型和CYP2C19*3型等位基因。2006年Sim等发现了一种新的CYP2C19等位基因CYP2C19*17,带有的突变位点是:–806C>T。CYP2C19*17等位基因在人群中也有较高的频率出现,CYP2C19*17型则引起CYP2C19基因编码的酶活性增强,代谢底物的能力增强,因此需要增加药物剂量。
目前临床或实验室检测CYP2C19基因多态性的方法很多,包括测序法、基因芯片法和荧光定量PCR法等。但各种检测方法均是针对单一的单核苷酸多态性位点(SNP)进行检测的,检测时间较长且检测成本较高,但上述三个突变位点的突变频率较高,单独检测不仅耗时费力且准确率低,难以在短时间内给出位点的定性结论。因而无法实时准确地给予被测者准确的代谢疗效预测和用药指导。
综上,研发一款对CYP2C19基因CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17这3个位点的多态性进行定性检测的快速扩增盒及扩增检测方法,是十分重要的。
发明内容
针对现有技术存在的上述问题,本发明的目的获得一种CYP2C19基因的快速扩增试剂盒及扩增方法。
为实现上述发明目的之一,本发明采用的CYP2C19基因的快速扩增试剂盒的技术方案如下:
所述试剂盒内包括三对扩增引物、Taq酶、dNTPs和缓冲液,其中扩增引物用于扩增CYP2C19*2型、CYP2C19*3型和CYP2C19*17型中的至少两个SNP位点,每对引物分别对应其中一个SNP位点的上下游区域。试剂盒中包含三对引物分别对应三个SNP位点,扩增时可以同时扩增三个SNP位点或任意选择两个位点进行扩增,使得试剂盒的使用更加灵活,并且三对引物经过精确设计,扩增效率高错配低,扩增产物易检测易分离,便于进一步的测序或检测工作的顺利进行。
CYP2C19*2型的扩增模板序列如序列表SEQ ID NO:1所示,CYP2C19*3型的扩增模板序列如序列表SEQ ID NO:2所示,CYP2C19*17型的扩增模板序列如序列表SEQ ID NO:3所示。
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