[发明专利]一种MTRR的SNP位点的快速扩增检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201711267655.5 | 申请日: | 2017-12-05 |
公开(公告)号: | CN109468371A | 公开(公告)日: | 2019-03-15 |
发明(设计)人: | 不公告发明人 | 申请(专利权)人: | 湘潭智联技术转移促进有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 410100 湖南省湘潭*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 扩增 焦磷酸测序 试剂盒 扩增产物 扩增检测 扩增效率 线性指数 退火 扩增引物序列 强碱性试剂 扩增片段 扩增引物 目标片段 实验步骤 引物序列 单链DNA 检测 测序 错配 双链 损伤 | ||
1.一种MTRR的SNP位点的快速扩增检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒由高效扩增组和焦磷酸测序组组成,其中高效扩增组包括:扩增引物、DNA聚合酶、扩增缓冲液、dNTPs和Mg2+,高效扩增组用于MTRR A66G的SNP位点的线性指数PCR扩增;扩增产物退火后经焦磷酸测序组测序,焦磷酸检测组包括:退火引物、DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶、三磷酸腺苷双磷酸酶、dNTP,以及Klenow酶。
2.根据权利要求1所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测试剂盒,其特征在于:扩增引物序列如序列表SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。
3.根据权利要求1所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测试剂盒,其特征在于:退火引物序列如序列表SEQ ID NO:4所示。
4.根据权利要求1所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测试剂盒,其特征在于:所述扩增引物中一个为过量引物,另一个为限制性引物。
5.根据权利要求1所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测试剂盒,其特征在于:所述过量引物的数量是限制性引物的至少10倍。
6.一种采用根据权利要求1~5任一项所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测试剂盒的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
a)提取DNA样本;
b)以提取出的DNA样本为模板,利用如序列表SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示的扩增引物,进行线性指数PCR扩增;
c)将扩增产物进行退火处理,制备单链模板;
d)将制备好的单链模板进行焦磷酸测序,确定SNP位点的基因型。
7.根据权利要求6所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测方法,其特征在于:所述DNA样本为经抽提处理的DNA模板。
8.根据权利要求6所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测方法,其特征在于,线性指数PCR扩增的条件包括:95℃预变性5min,60℃扩增循环,72℃延伸10min,4℃保持。
9.根据权利要求8所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测方法,其特征在于:60℃扩增循环由87℃10s、66℃10s和72℃20s组成一个循环。
10.根据权利要求6所述的MTRR的SNP位点的快速扩增检测方法,其特征在于,扩增产物退火制备单链模板的步骤c具体为:
在扩增产物中加入焦磷酸测序用的DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和Klenow酶,静止3~5min后加入三磷酸腺苷双磷酸酶,加入如序列表SEQ ID NO:4所示的退火引物,室温退火10~15min。
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