[发明专利]一种辅助检测猪100kg背膘厚的方法

说明书

本发明公开一种一种辅助检测猪100kg背膘厚的方法。本发明公开的方法可对待选猪进行早期筛选，有效地缓解实际生产中的选取优良种猪时间长的问题，降低了育种花费，有效降低或提高实际生产中的猪100kg背膘厚，该方法准确度高，检测费用低，并可实现自动化检测，在猪的育种方面具有很高的实践应用价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种辅助检测猪100kg背膘厚的方法。

背景技术

鉴于猪100kg背膘厚性状是影响猪生长速度、瘦肉率及胴体分级的重要因素之一，一直以来，100kg背膘厚性状是世界范围内种猪育种的重点经济性状之一。因此，针对这种性状，研究者们开展了大量的分子研究工作。其中，QTL定位研究表明，猪7号染色体上存在一个猪100kg背膘厚性状QTL区间，次区间的范围为50.3-120.7Mb(Malek M,Dekkers JC,Lee HK,Baas TJ,Rothschild MF.A molecular genome scan analysis to identifychromosomal regions influencing economic traits in the pig.I.Growth and bodycomposition.Mamm Genome 2001,12(8):630-636.)。因此，研究此区间内影响100kg背膘厚性状的分子标记单倍型成为了研究重点工作之一。

发明内容

本发明的第一个目的是提供一种与猪100kg背膘厚相关的方法及其应用。

本发明所提供的应用具体可为如下：猪基因组中由如下3个SNP位点组成的单倍型多态性在辅助检测待测猪的100kg背膘厚中的应用。

本发明所提供的应用具体可为如下中的任一种：(1)猪基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性在鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚中的应用；(2)用于检测猪基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚中的应用。

所述SNP位点为：以猪基因组DNA为模板，采用由序列表中序列1所示的单链DNA和序列表中序列2所示的单链DNA组成的引物对进行PCR扩增所得扩增产物的自5’末端起第214位核苷酸；所述SNP位点处的核苷酸为A或G。

该SNP位点位于GPX2基因内的国际猪基因组10.2版本参考序列7号染色体上第95392358个核苷酸位点AG突变(记为g.95392358AG)。

本发明的第二个目的是提供一种用于鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚的试剂。

本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚的试剂，是用于检测猪基因组中SNP位点(g.95392358AG)的单核苷酸多态性的物质；

所述“用于检测猪基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质”可以能够鉴定SNP位点(g.95392358AG)的单核苷酸多态性的任何物质，如为如下(a)或(b)所示的引物对：

(a)由序列表中序列1所示的单链DNA和序列表中序列2所示的单链DNA组成的引物对；

(b)由将序列表中序列1和序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所

示的两条单链DNA分子组成的，且与(a)中所述引物对功能相同的引物对。

本发明的第三个目的是提供一种用于鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚的试剂盒。

本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚的试剂盒，含有所述试剂。

所述试剂或所述试剂盒在鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚中的应用也属于本发明的保护范围。

本发明的第四个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测猪的100kg背膘厚的方法。