[发明专利]靶向RNA甲基化的RNA Cas9-m6A修饰载体系统及其构建方法和应用有效

专利信息
申请号: 201711334357.3 申请日: 2017-12-12
公开(公告)号: CN108103090B 公开(公告)日: 2021-06-15
发明(设计)人: 纪卫东;应小玲;张海青;王敏 申请(专利权)人: 中山大学附属第一医院
主分类号: C12N15/79 分类号: C12N15/79;C12N15/66;C12N15/52;A61K31/711
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 宋静娜;郝传鑫
地址: 510000 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 靶向 rna 甲基化 cas9 m6a 修饰 载体 系统 及其 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.靶向mRNA的6-甲基腺嘌呤修饰载体系统,其特征在于,所述载体系统包括失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白的表达载体、靶向CDCP1的mRNA的3’UTR区中至少一个位点的sgRNA表达载体以及与作为标靶的mRNA错配的寡核苷酸;

所述失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白的表达载体为pcDNA3.1-dcas9-2×NLS-METTL3 活性区域 -EGFP载体,所述pcDNA3.1-dcas9-2×NLS-METTL3 活性区域 -EGFP载体构成为:(a)dCas9-2×NLS序列如SEQ ID NO.1所示、(b)METTL3 活性区域 序列如SEQ ID NO.2所示、(c)EGFP序列如SEQ ID NO.3所示;

所述sgRNA表达载体靶向CDCP1的mRNA的3’UTR区155位点或173位点或212位点;所述sgRNA表达载体的序列分别对应如SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.17所示;所述寡核苷酸的序列如SEQ ID NO.14所示。

2.靶向mRNA的6-甲基腺嘌呤修饰载体系统的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)从载体pHR-SFFV-KRAB-dCas9-P2A-mCherry扩增出dCas9-2×NLS序列,从HUVEC细胞中扩增出METTL3酶活性区域序列,从载体pLKO.3G扩增出EGFP序列,通过PCR扩增、酶切、连接、转化,将dCas9-2×NLS序列,METTL3活性区域序列以及EGFP序列连接至pcDNA3.1V5HisTOPO载体,得到失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白表达载体;所述dCas9-2×NLS序列如SEQ ID NO.1所示;所述METTL3 活性区域 序列如SEQ ID NO.2所示;所述EGFP序列如SEQ ID NO.3所示;

2)构建包括酶切位点序列和sgRNA支架序列的sgRNA支架结构;合成基于靶点序列的sgRNA;将所述sgRNA支架结构和基于靶点序列的sgRNA克隆至表达载体中,得到包括启动子序列、基于靶点序列的sgRNA、sgRNA支架序列和酶切位点序列的表达载体,所述基于靶点序列的sgRNA分别如SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.17所示;

3)合成基于靶点序列、并与作为标靶的mRNA错配的寡核苷酸,所述寡核苷酸的序列如SEQ ID NO.14所示;

所述靶向mRNA的6-甲基腺嘌呤修饰载体系统包括所述失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白表达载体、所述寡核苷酸以及所述包括启动子序列、基于靶点序列的sgRNA、sgRNA支架序列和酶切位点序列的表达载体。

3.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于,所述步骤2)中的表达载体为pBlueScript II SK(-)质粒或Lentiguide-puro载体。

4.权利要求1所述的载体系统在制备治疗RNA修饰异常引起的疾病的药物中的应用。

5.一种治疗RNA修饰异常引起的疾病的药物,其特征在于,所述药物包含权利要求1所述的载体系统。

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