[发明专利]靶向RNA甲基化的RNA Cas9-m6A修饰载体系统及其构建方法和应用有效
申请号: | 201711334357.3 | 申请日: | 2017-12-12 |
公开(公告)号: | CN108103090B | 公开(公告)日: | 2021-06-15 |
发明(设计)人: | 纪卫东;应小玲;张海青;王敏 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属第一医院 |
主分类号: | C12N15/79 | 分类号: | C12N15/79;C12N15/66;C12N15/52;A61K31/711 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 宋静娜;郝传鑫 |
地址: | 510000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 靶向 rna 甲基化 cas9 m6a 修饰 载体 系统 及其 构建 方法 应用 | ||
1.靶向mRNA的6-甲基腺嘌呤修饰载体系统,其特征在于,所述载体系统包括失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白的表达载体、靶向CDCP1的mRNA的3’UTR区中至少一个位点的sgRNA表达载体以及与作为标靶的mRNA错配的寡核苷酸;
所述失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白的表达载体为pcDNA3.1-dcas9-2×NLS-METTL3 活性区域 -EGFP载体,所述pcDNA3.1-dcas9-2×NLS-METTL3 活性区域 -EGFP载体构成为:(a)dCas9-2×NLS序列如SEQ ID NO.1所示、(b)METTL3 活性区域 序列如SEQ ID NO.2所示、(c)EGFP序列如SEQ ID NO.3所示;
所述sgRNA表达载体靶向CDCP1的mRNA的3’UTR区155位点或173位点或212位点;所述sgRNA表达载体的序列分别对应如SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.17所示;所述寡核苷酸的序列如SEQ ID NO.14所示。
2.靶向mRNA的6-甲基腺嘌呤修饰载体系统的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)从载体pHR-SFFV-KRAB-dCas9-P2A-mCherry扩增出dCas9-2×NLS序列,从HUVEC细胞中扩增出METTL3酶活性区域序列,从载体pLKO.3G扩增出EGFP序列,通过PCR扩增、酶切、连接、转化,将dCas9-2×NLS序列,METTL3活性区域序列以及EGFP序列连接至pcDNA3.1V5HisTOPO载体,得到失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白表达载体;所述dCas9-2×NLS序列如SEQ ID NO.1所示;所述METTL3 活性区域 序列如SEQ ID NO.2所示;所述EGFP序列如SEQ ID NO.3所示;
2)构建包括酶切位点序列和sgRNA支架序列的sgRNA支架结构;合成基于靶点序列的sgRNA;将所述sgRNA支架结构和基于靶点序列的sgRNA克隆至表达载体中,得到包括启动子序列、基于靶点序列的sgRNA、sgRNA支架序列和酶切位点序列的表达载体,所述基于靶点序列的sgRNA分别如SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.17所示;
3)合成基于靶点序列、并与作为标靶的mRNA错配的寡核苷酸,所述寡核苷酸的序列如SEQ ID NO.14所示;
所述靶向mRNA的6-甲基腺嘌呤修饰载体系统包括所述失活的Cas9核酸酶融合6-甲基腺嘌呤修饰酶的酶活性功能区的蛋白表达载体、所述寡核苷酸以及所述包括启动子序列、基于靶点序列的sgRNA、sgRNA支架序列和酶切位点序列的表达载体。
3.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于,所述步骤2)中的表达载体为pBlueScript II SK(-)质粒或Lentiguide-puro载体。
4.权利要求1所述的载体系统在制备治疗RNA修饰异常引起的疾病的药物中的应用。
5.一种治疗RNA修饰异常引起的疾病的药物,其特征在于,所述药物包含权利要求1所述的载体系统。
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