[发明专利]一种目标区域多重PCR与快速文库构建的方法有效
申请号: | 201711347145.9 | 申请日: | 2017-12-15 |
公开(公告)号: | CN108103143B | 公开(公告)日: | 2021-11-09 |
发明(设计)人: | 胡春旭;陆思嘉;任军 | 申请(专利权)人: | 序康医疗科技(苏州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/686;C40B50/06 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人: | 黄革生 |
地址: | 215000 江苏省苏州市工业*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 目标 区域 多重 pcr 快速 文库 构建 方法 | ||
1.一种通过多重PCR扩增DNA并构建文库的方法,包括:
(1) 获取样本DNA;
(2) 使用添加了锚定接头且经过修饰的特异性引物对的集合,对步骤(1)得到的样本DNA进行第一轮PCR,所述添加了锚定接头且经过修饰的特异性引物对从5’到3’具有如下结构:
5’修饰的锚定接头序列+针对待扩增区域的特异性序列;
(3) 不添加新的引物,将步骤(2)得到的产物在新的反应体系中进行第二轮PCR,使得全部引物被用于扩增;
(4) 使用特殊设计的文库构建引物对,以所述特异性引物对上的所述锚定接头为引物锚定区域,进行扩增的同时在包含目标基因/区段的扩增子两端加上文库接头,所述文库构建引物对包含的引物从5’到3’具有如下结构:
5’修饰的文库接头+锚定接头序列;
(5)构建测序文库,其中纯化回收步骤(4)的扩增产物,获得所述文库,其中所述文库具有适于测序分析的片段长度分布范围;
其中,
步骤(2)中正向引物的5’修饰的锚定接头序列为5’-NH2-C6-GCTCTTCCGATCTMM,M为A或C;
步骤(2)中反向引物的5’修饰的锚定接头序列为5’-NH2-C6-GCTCTTCCGATCTKK,K为G或T;且
其中
步骤(4)中正向引物为5’NH2-C6-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTMM,
反向引物为5’NH2-C6-CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATNNNNNNGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTKK,
其中M为A或C;K为G或T,N为任意碱基。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述特异性引物对的集合包括20-2000个引物对。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中,所述步骤(2)的引物对中包括的特异性序列的长度为10-40bp,且其中所述步骤(5)的文库具有200-500bp的片段长度分布范围。
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