[发明专利]一种用于检测人KRAS基因突变的试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 201711370355.X | 申请日: | 2017-12-19 |
公开(公告)号: | CN107904292A | 公开(公告)日: | 2018-04-13 |
发明(设计)人: | 汪元涛;朱月艳;孙子奎 | 申请(专利权)人: | 上海派森诺医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 上海天翔知识产权代理有限公司31224 | 代理人: | 吕伴 |
地址: | 201799 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 kras 基因突变 试剂盒 及其 方法 | ||
1.MGB探针和内参反应引物、MGB探针:
(1)突变检测反应(KRAS-mutation)引物、MGB探针如下:
G12C-F:AATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCAT;
G12S-F AATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCGA;
G12R-F AATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCAC;
G12V-F ATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTCT;
G12D-F AAACTTGTGGTAGTTGGAGCGGA;
G12A-F AACTTGTGGTAGTTGGAGCTTC;
G13D-F GTGGTAGTTGGAGCTGGAGA;
KRAS-R CATATTCGTCCACAAAATGATTCTG;
MGB-KRAS FAM-CTGTATCGTCAAGGCACT-MGB;
(2)内参反应(KRAS-ref)引物、MGB探针如下:
KRAS-F GACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGA;
KRAS-R CATATTCGTCCACAAAATGATTCTG;
MGB-KRAS FAM-CTGTATCGTCAAGGCACT-MGB。
其中,F:正向引物,R:反向引物。
试剂盒中的其他试剂及溶液为PCR和DNA测序的常规试剂。
2.一种应用权利要求1所述的试剂盒检测人KRAS基因突变的方法,其特征在于,包括:
1)提取样本DNA,使用天根生化科技(北京)有限公司:石蜡包埋组织DNA提取试剂盒,货号为DP331;
2)PCR扩增:
按下表配置荧光定量PCR反应体系(20μL):
每条引物的终浓度均为200nM,Taqman探针的终浓度为50nM。
PCR反应程序:37℃,2min;95℃预变性10min;50cycles:95℃,10sec、60℃40sec(收集荧光)。
荧光定量PCR时,将Ref反应设置成内参,在荧光定量结束后,可直接读取样本的△Ct值。
每个批次检测反应均设置阳性对照(PC)、阴性对照(NC)和空白对照(NTC)。其中,2×qPCR mix包含:Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、MgCl2以及反应缓冲液。
3)结果分析:PC、NC和NTC均正常,结果有效。
△Ct=Ct(KRAS-mutation)-Ct(KRAS-ref)。当△Ct≤10.0时,判定检测结果为阳性,即存在KRAS基因突变;当△Ct>10.0时,判定检测结果为阴性,即KRAS基因为野生型。
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