[发明专利]用于检测与有机磷农药相关的Ⅱ型糖尿病的易感基因芯片在审
申请号: | 201711386787.X | 申请日: | 2017-12-20 |
公开(公告)号: | CN108004314A | 公开(公告)日: | 2018-05-08 |
发明(设计)人: | 董玉玮;张传丽;李文;王陶;李同祥;高明侠 | 申请(专利权)人: | 徐州工程学院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 北京国坤专利代理事务所(普通合伙) 11491 | 代理人: | 赵红霞 |
地址: | 221008 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 有机磷 农药 相关 糖尿病 基因芯片 | ||
1.一种用于检测与有机磷农药相关的Ⅱ型糖尿病的易感基因芯片,其特征在于,所述用于检测与有机磷农药相关的Ⅱ型糖尿病的易感基因芯片包括以醛基玻璃为材质的固定相载体,用于检测与有机磷农药相关的导致的Ⅱ型糖尿病易感基因的特异性寡核苷酸探针;
所述特异性寡核苷酸探针的核苷酸序列SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8,探针被固定在固相载体上。
2.如权利要求1所述的用于检测与有机磷农药相关的Ⅱ型糖尿病的易感基因芯片,其特征在于,所述用于检测与有机磷农药相关的Ⅱ型糖尿病的易感基因芯片为:
(1)芯片共分4块相同部分,每个部分是由56个样品点组成的4行×14列矩阵,分为检测区和对照区;其中,检测区为:
①芯片阳性对照,序号SEQ ID NO:9,布控于左上、右上、中下三个位置,作为阳性对照样点,共12个,也起定位作用;
②芯片平行对照,采用SEQ ID NO:1~8探针等量混合的25uM溶液点样,一个基因位点检测区由上面2个点和下面2个点共4个点组成;
(2)对照区为:序号SEQ ID NO:10,芯片阴性对照,为TE溶液,共12个阴性对照样点,布控于左下、右下、中上三个位置。
3.一种如权利要求1所述用于检测与有机磷农药相关的Ⅱ型糖尿病的易感基因芯片的制备方法,其特征在于,所述制备方法包括以下步骤:
(1)玻璃经醛基化修饰后预处理为固相载体;
(2)探针制备方法为,探针5’端含有15个氨基修饰的多聚dT,并经氨基基团修饰,而后用TE溶液按1:1比例稀释至终浓度为25μM;
(3)PBS溶液清洗点样仪点样针,校正;用于扩增4个易感基因突变位点的引物序列为SEQ ID NO:11~18,将特异性寡核苷酸探针的核苷酸序列作为寡核苷酸探针,采用芯片点样仪将稀释好的寡核苷酸探针印点到固相载体上,避光放置过夜,湿度65-75%,干燥芯片;
(4)干燥后,于紫外交联仪中固定芯片30min,强度600MJ,取出后将芯片置于含有饱和NaCl溶液的湿盒中,42℃水化过夜;
(5)水化后芯片在室温下2×SSC-0.1%SDS溶液中洗涤2-3次,每次各5min,0.5×SSC-0.1%SDS溶液中洗涤2次,每次各5min,双蒸水中洗涤2-3次,风干,获得基因芯片,4℃保存避光保存备用。
4.如权利要求3所述的制备方法,其特征在于,所述4个易感基因为MTHFR、CAPN10、LEP、IL1A。
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