[发明专利]运用CRISPRi基因敲低技术快速构建急性脑科学研究模型的方法在审
申请号: | 201711402221.1 | 申请日: | 2017-12-22 |
公开(公告)号: | CN108048485A | 公开(公告)日: | 2018-05-18 |
发明(设计)人: | 姚骏;郑毅 | 申请(专利权)人: | 清华大学 |
主分类号: | C12N15/867 | 分类号: | C12N15/867;C12N15/90;C12N9/22;C12N5/10 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 10008*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 运用 crispri 基因 技术 快速 构建 急性 脑科学 研究 模型 方法 | ||
1.sgRNA/CRISPRi在非分裂的细胞中进行基因改造中的用途。
2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于,所述非分裂的细胞为神经元细胞,
任选地,所述神经元细胞为兴奋性谷氨酸能神经元或抑制性中间神经元,
任选地,所述基因改造是通过如下方式实现的:
将无内毒素的sgRNA/CRISPRi表达质粒与pVSVG,psPAX2导入受体细胞,以便获得携带有sgRNA/CRISPRi的慢病毒,所述sgRNA/CRISPRi为靶向基因的sgRNA/CRISPRi;以及利用所述慢病毒感染所述神经元细胞;
任选地,所述受体细胞为HEK 293FT细胞;
任选地,所述导入是PEI介导的。
3.根据权利要求2所述的用途,其特征在于,所述基因包括选自Syt1、Vamp2、Stx1a、Snap25、Stx1b、Doc2a、Doc2b以及DsRed的至少之一。
4.根据权利要求3所述的用途,其特征在于,所述sgRNA靶向基因转录起始区的上游-50bp~下游300bp;
任选地,所述sgRNA具有SEQ ID NO:1~15所示的核苷酸序列。
5.根据权利要求4所述的用途,其特征在于,所述sgRNA/CRISPRi表达质粒是通过如下方式获得的:
(1)提供初始慢病毒质粒,所述初始慢病毒质粒一包含顺序连接的人源U6启动子、填充序列、sgRNA骨架序列、聚合酶III型转录终止子、EFS启动子、dCas9-KRAB、核定位信号、P2A、EGFP和WPRE核酸序列元件;
(2)将退火的所述sgRNA插入到BsmbI消化的所述初始慢病毒质粒,以获得单个sgRNA/CRISPRi的一体化表达质粒。
6.根据权利要求4所述的用途,其特征在于,所述sgRNA/CRISPRi表达质粒是通过如下方式获得的:
(1)提供初始慢病毒质粒,所述初始慢病毒质粒包含顺序连接的人源U6启动子、填充序列、第二sgRNA骨架序列、聚合酶III型转录终止子、EFS启动子、dCas9-KRAB、核定位信号、P2A、EGFP和WPRE核酸序列元件;
(2)提供模板质粒,所述模板质粒包括第一sgRNA骨架序列、聚合酶III型转录终止子和人源H1启动子核酸序列元件;
(3)通过PCR扩增所述模板质粒,其中,PCR正向引物3’端包括所述第一sgRNA骨架序列的5’端序列,所述PCR正向引物的5’端具有BsmbI识别序列和待插入第一sgRNA序列,PCR反向引物3’端包括所述人源H1启动子序列的3’端序列,所述PCR反向引物的5’端具有待插入第二sgRNA的反向互补序列和BsmbI识别序列;
优选地,所述PCR正向引物和反向引物具有SEQ ID NO:16或17所示的核苷酸序列;
(4)将(3)中的PCR扩增产物用BsmbI消化后,与所述初始慢病毒质粒连接,以获得两个sgRNA/CRISPRi表达质粒,
优选地,所述聚合酶III型转录终止子和人源H1启动子核酸序列元件紧密连接。
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