[发明专利]一种分析体系内相似序列相对数量的方法在审
| 申请号： | 201711477562.5 | 申请日： | 2017-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN108251517A | 公开（公告）日： | 2018-07-06 |
| 发明（设计）人： | 李阳;谢先荣;王世阳 | 申请（专利权）人： | 武汉艾德士生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人： | 董建林;徐瑛 |
| 地址： | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区高新大*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 同源序列 测序 扩增 计算机程序 差异序列 峰值数据 功能基因 平均信号 重要意义 分析 表达量 比对 参比 位点 引物 检测 统计 研究 | ||
1.一种分析体系内相似序列相对数量的方法，其特征在于，包括如下步骤：将待检测的至少两种同源序列用一引物对进行扩增，扩增结果进行一代测序，将测序得到的峰值数据以及作为参比差异序列的所述同源序列一起提交给计算机程序进行比对，统计每个序列所有差异位点的平均强度，各序列平均信号强度的比值即代表了所述同源序列的数量比值。
2.根据权利要求1所述的一种分析体系内相似序列相对数量的方法，其特征在于，所述扩增过程对所有所述同源序列具有同样的扩增效率。
3.根据权利要求2所述的一种分析体系内相似序列相对数量的方法，其特征在于，所述引物对与所述同源序列均为100％匹配，扩增过程选定的扩增靶标DNA中差异位点范围为4～30个。
4.根据权利要求3所述的一种分析体系内相似序列相对数量的方法，其特征在于，所述参比差异序列为所述扩增靶标DNA中的所有同源序列。
5.根据权利要求1所述的一种分析体系内相似序列相对数量的方法，其特征在于，每次比对的所述同源序列为两种。
6.根据权利要求1～5任一项所述的一种分析体系内相似序列相对数量的方法，其特征在于，所述计算机程序进行比对的方法包括：先根据提交的参比差异序列算出所有差异位点，记录这些差异位点的具体碱基和在序列中的位置；然后根据这些位置信息在测序结果文件数据中找出这些位置上4种碱基的信号强度，并记录；统计所有差异位点上不同碱基的信号强度；对每个位点的信号强度进行均一化；统计每个序列所有差异位点的平均强度，各序列平均信号强度的比值代表了起始体系中各同源序列的数量比值。
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