[发明专利]利用相位移区块合成条码化序列及其用途有效
申请号: | 201780006243.8 | 申请日: | 2017-01-12 |
公开(公告)号: | CN108495938B | 公开(公告)日: | 2023-07-14 |
发明(设计)人: | L·弗兰茨;J·阿格雷丝迪 | 申请(专利权)人: | 生物辐射实验室股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12P19/34;C40B40/06;G01N33/50 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陈扬扬;余颖 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 相位 区块 合成 条码 序列 及其 用途 | ||
1.一种条码寡核苷酸文库,各条码寡核苷酸包括可变区域、通用区域和相位移区域,
其中,所述相位移区域在所述通用区域的5'方向并且在所述可变区域的5'方向,第一条码寡核苷酸的通用区域的第一核苷酸与第二条码寡核苷酸的通用区域的第一核苷酸错开1-50个核苷酸。
2.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,一个或多个条码寡核苷酸处于分区中。
3.如权利要求1或2所述的条码寡核苷酸文库,其中,各条码寡核苷酸与珠连接。
4.如权利要求3所述的条码寡核苷酸文库,其中,所述珠是水凝胶珠、塑料珠、玻璃珠或金属珠。
5.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,各条码寡核苷酸的所述相位移区域具有1-50个核苷酸的长度。
6.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,所述通用区域在3'末端与核苷酸序列连接。
7.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,各条码寡核苷酸的所述可变区域具有至少3个核苷酸的长度。
8.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,各条码寡核苷酸包括超过一个可变区域。
9.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,各条码寡核苷酸的所述通用区域包括相同的序列,并且,其中,所述通用区域具有至少6个核苷酸的长度。
10.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,各条码寡核苷酸包括超过一个通用区域。
11.如权利要求1所述的条码寡核苷酸文库,其中,各条码寡核苷酸还包括捕获区域。
12.如权利要求11所述的条码寡核苷酸文库,其中,所述捕获区域包括聚胸苷序列、聚腺苷序列或随机序列。
13.如权利要求1或4所述的条码寡核苷酸文库,其中,所述条码寡核苷酸包括至少两个可变区域,所述可变区域被通用区域分隔。
14.一种条码珠文库,其包括:多个珠,其中,各珠与多个条码寡核苷酸偶联,并且其中,所述文库中的各珠与独特的条码寡核苷酸偶联,
各条码寡核苷酸包括可变区域、通用区域和相位移区域,
其中,所述相位移区域在所述通用区域的5'方向并且在所述可变区域的5'方向,第一条码寡核苷酸的通用区域的第一核苷酸与第二条码寡核苷酸的通用区域的第一核苷酸错开1-50个核苷酸;并且
其中,对于各珠,条码寡核苷酸的至少两个相同的拷贝与所述珠偶联。
15.如权利要求14所述的文库,其中,所述通用区域之内和之后存在至少两个不同的核苷酸,其位于所述多个条码寡核苷酸中的所述条码寡核苷酸的任意位置。
16.如权利要求14或15所述的文库,其中,在所述多个条码寡核苷酸的每一个中,所述通用区域包括相同的序列。
17.如权利要求14所述的文库,其中,所述多个条码寡核苷酸中每一个的所述相位移区域具有1-50个核苷酸的长度。
18.如权利要求14所述的文库,其中,所述多个条码寡核苷酸中每一个的所述可变区域具有至少3个核苷酸的长度。
19.如权利要求14所述的文库,其中,各条码寡核苷酸包括超过一个可变区域。
20.如权利要求14所述的文库,其中,所述多个条码寡核苷酸的所述通用区域具有至少6个核苷酸的长度。
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