[发明专利]用于IHC图像分析的空间索引创建有效
申请号: | 201780020941.3 | 申请日: | 2017-03-02 |
公开(公告)号: | CN109074645B | 公开(公告)日: | 2021-12-14 |
发明(设计)人: | F·梅奇;A·富赫斯;J·金策尔;O·胡贝尔;A·科恩;E·古特赫莱恩 | 申请(专利权)人: | 豪夫迈·罗氏有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/73;G06T7/50;G06K9/62;G06K9/00;G06T7/60;G06T7/33;G16H30/20 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人: | 徐国栋;林柏楠 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 ihc 图像 分析 空间 索引 创建 | ||
1.一种用于分析IHC组织样本(100)的图像分析方法,该方法包括:
-为数字图像(106.1-106. 4;106.5-106.7)的一个或多个集合(112;113)中的每一个在空间DBMS(316)的空间数据库(318)中存储(702)集合ID,每个数字图像集的数字图像描绘IHC组织样本的相同(102)或相邻层(102;110;108);
-为每个数字图像在空间数据库中存储(704)与集合ID相关联的多个空间数据对象,每个空间数据对象是点,线,多边形或其组合并表示组织样本的生物医学特征,由数据对象表示的组织样本的生物医学特征属于至少两种不同类型的生物医学特征;
-通过空间DBMS创建(706)至少一个空间索引,该空间索引覆盖包含在一个或多个集合中的数字图像的空间数据对象,其中对于一个或多个数字图像集中每一个的至少两种不同类型生物医学特征中的每一种,创建相应的空间索引或至少一个空间索引的分区;
-选择(708)一个或多个数字图像集中的一个;
-通过空间DBMS对至少一个空间索引应用(710)空间数据库操作,以确定所选数字图像集的两个或更多个数字图像的空间数据对象的相对位置;
-提供(712)所述相对位置作为输入,用于确定由两个或更多个数字图像的空间数据对象表示的组织样本的生物医学特征的距离和/或相对位置。
2.根据权利要求1所述的图像分析方法,其中每个空间数据对象作为数据记录存储在空间数据库的表的相应行中。
3.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法,其中所述空间索引选自包括以下各项的组:
-R树索引;
-R+树索引;
-R*树索引;
-希尔伯特R树索引;
-四叉树索引;
-网格空间索引;
-Z阶指数;
-UB树索引;
-X树索引;
-Kd树索引;
-m树索引;
-二进制空间分区(BSP树)索引。
4.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法,其中所述至少两种类型选自包括特定细胞类型,特定细胞器类型,特定簇类型的细胞簇,跨越多个细胞的特定解剖结构,特定组织类型,肿瘤组织的组。
5.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法,还包括:
-自动识别一个或多个集合的一些或所有数字图像中的一个或多个生物特征,该识别包括自动执行斑点提取和斑点分类操作,用于自动分类表示特定类型生物特征的数字图像的像素区域;和/或
-由空间DBMS(316)接收一个或多个集合的一些或所有数字图像中的一个或多个其他生物特征,所接收的其他生物特征为手动分类的代表特定类型生物特征的数字图像的像素区域;
-从自动识别和/或手动分类的生物医学特征中自动提取空间数据对象,并在提取的空间数据对象上执行空间数据对象的存储。
6.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法,还包括:
-对于一个或多个数字图像集中每一个的每个数字图像,创建相应的空间索引或创建至少一个空间索引的分区。
7.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法,所述方法还包括在执行所述空间数据对象的相对位置的分析之前执行预处理操作,所述预处理包括:
-通过空间DBMS自动预先计算数字图像的空间数据对象的区域大小,几何中心和/或最小边界矩形;和
-使用预先计算的区域大小,几何中心和/或最小边界矩形来确定生物医学特征的距离和/或相对位置。
8.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法,所述方法还包括:
-通过图像分析应用程序生成每个数字图像集,该生成包括执行图像配准操作,用于将描绘IHC组织样本的相同或相邻层的多个数字图像配准到公共坐标系中。
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