[发明专利]用于IHC图像分析的空间索引创建

说明书

本发明涉及一种用于分析IHC组织样本(100)的图像分析方法。该方法包括：‑为数字图像(106.1‑106‑4；106.5‑106.7)的一个或多个集合(112；113)中的每一个在空间DBMS(316)的空间数据库(318)中存储(702)集合ID，每个数字图像集的数字图像描绘IHC组织样本的相同(102)或相邻层(102；110；108)；‑为每个数字图像在空间数据库中存储(704)与集合ID相关联的多个空间数据对象，每个空间数据对象是点，线，多边形或其组合并表示组织样本的生物医学特征；‑通过空间DBMS创建(706)至少一个空间索引，该空间索引覆盖包含在一个或多个集合中的数字图像的空间数据对象；‑选择(708)数字图像的一个或多个集合中的一个；‑通过空间DBMS对至少一个空间索引应用(710)空间数据库操作，以确定所选数字图像集的两个或更多个数字图像的空间数据对象的相对位置；‑提供(712)相对位置作为输入，用于确定由两个或更多个数字图像的空间数据对象表示的组织样本的生物医学特征的距离和/或相对位置。

描述

发明领域

本发明涉及一种用于分析IHC组织样本的图像的图像分析系统。

背景和相关技术

存在多种病理学数字成像解决方案，旨在生成大量组织样本的数字图像和/或生成全切片(whole slide)的高分辨率图像。用于诊断，教育和研究目的的大量数字图像，特别是高分辨率全切片图像的处理可能非常复杂并且可能消耗大量计算资源，特别是CPU和内存。计算机处理能力，数据传输速度和云存储解决方案的增益使得数字图像在病理学中用于更广泛的目的，但是处理和分析大量数字图像，特别是全切片图像，仍然是一个通常无法以合理的成本使用现有图像处理技术充分解决的技术挑战。

本发明的目的是提供一种改进的图像分析系统和相应的图像分析方法。

发明概述

本发明提供了用于分析IHC组织样本的图像分析系统，相应的图像分析方法和数据库管理系统，如各个独立权利要求所述。在从属权利要求中给出了本发明的实施方案。本发明的实施方案可以彼此自由组合，只要它们不相互排斥。

在一个方面，本发明涉及用于分析IHC组织样本的图像分析方法。该方法包括：

-为数字图像的一个或多个集合中的每一个在空间DBMS的空间数据库中存储集合ID，每个数字图像集合的数字图像描绘IHC组织样本的相同或相邻层；

-为每个数字图像在空间数据库中存储与集合ID相关联的多个空间数据对象，每个空间数据对象是点，线，多边形或其组合并表示组织样本的生物医学特征；

-通过空间DBMS创建至少一个空间索引，该空间索引覆盖包含在一个或多个集合中的数字图像的空间数据对象；

-选择一个或多个数字图像集中的一个；

-通过空间DBMS对至少一个空间索引应用空间数据库操作，以确定所选数字图像集的两个或更多个数字图像的空间数据对象的相对位置；

-提供所述相对位置作为输入，用于确定由两个或更多个数字图像的空间数据对象表示的组织样本的生物医学特征的距离和/或相对位置。

为组织样本的一个或多个图像的空间数据记录生成至少一个空间索引可能是有利的，因为现在可以以高效的方式分析大量数字IHC图像中的多个生物医学特征的空间信息，包括全切片图像。

代替使用应用程序来执行生物医学特征的相对位置的分析，使用最初设计用于处理地理数据(即，完全不同类型的数据)的优化空间数据库操作。因此，可以避免进出用于确定图像中不同生物医学特征的相对位置的应用程序的数据流量。此外，通过对表示生物医学特征的空间数据对象使用空间数据库操作而不是用户定义的应用程序例程，可以使用适于快速处理大量空间数据对象的速度优化例程，从而进一步减少CPU和内存消耗。