[发明专利]预测肺癌患者中对ALK抑制剂疗法的响应的间变性淋巴瘤激酶中的新型突变

权利要求书

1.治疗具有肿瘤的患者的方法，所述肿瘤可能携带在间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因中具有突变的细胞，所述方法包括：

(a)测试来自所述患者的样品的ALK突变R1209Q (G3636A)和/或I1268V (A3802G)的存在，且

(b)如果存在突变R1209Q，则不将ALK抑制剂化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已经正在接受ALK抑制剂化合物，则施用替代ALK抑制剂化合物；且

(c)如果存在突变I1268V或不存在突变，则将ALK抑制剂化合物施用于所述患者。

2.权利要求1的方法，其中所述ALK抑制剂化合物或替代ALK抑制剂化合物选自艾乐替尼、克里唑替尼、色瑞替尼、艾乐替尼、布加替尼、劳拉替尼和恩曲替尼。

3.权利要求1或2的方法，其中使用与突变序列互补的寡核苷酸进行所述测试。

4.前述权利要求中任一项的方法，其进一步包括测试来自所述患者的样品的一种或多种选自L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的ALK突变的存在，并且如果存在任何所述突变，则不将ALK抑制剂化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已经正在接受ALK抑制剂化合物，则施用替代ALK抑制剂化合物。

5.前述权利要求中任一项的方法，其进一步包括：

测试来自所述患者的样品的一种或多种ALK融合产物的存在；

如果存在一种或多种ALK融合产物，则将ALK抑制剂化合物施用于所述患者；且

如果存在一种或多种ALK融合产物和一种或多种选自R1209Q、L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的突变，则不将ALK抑制剂化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已经正在接受ALK抑制剂化合物，则施用替代ALK抑制剂化合物。

6.用于确定癌症患者对ALK抑制剂化合物的响应的可能性的方法，其包括：测试来自所述患者的样品的ALK突变R1209Q和/或I1268V，且，如果存在突变R1209Q，则报告所述患者将可能不对所述ALK抑制剂化合物响应，且如果存在突变I1268V或不存在突变，则报告所述患者将可能对所述ALK抑制剂化合物响应。

7.权利要求6的方法，其中使用与突变序列互补的寡核苷酸进行所述测试。

8.权利要求6-7中任一项的方法，其进一步包括测试所述样品的一种或多种选自L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的ALK突变的存在，并且如果存在任何所述突变，则报告所述患者可能不对所述ALK抑制剂化合物响应，或如果所述患者已经正在接受ALK抑制剂化合物，则施用替代ALK抑制剂化合物。

9.权利要求6-8中任一项的方法，其进一步包括：

测试来自所述患者的样品的一种或多种ALK融合产物的存在；

如果存在一种或多种ALK融合产物，则将ALK抑制剂化合物施用于所述患者；且

如果存在一种或多种ALK融合产物和一种或多种选自R1209Q、L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的突变，则不将ALK抑制剂化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已经正在接受ALK抑制剂化合物，则施用替代ALK抑制剂化合物。

10.对于先前已经用艾乐替尼治疗的具有携带在基因中具有突变的细胞的肿瘤的患者选择间变性淋巴瘤激酶(ALK)抑制剂疗法的方法，其包括：

(a)测试来自所述患者的样品的ALK突变R1209Q (G3636A)和/或I1268V (A3802G)的存在，且

(b)如果存在突变R1209Q，则不向所述患者施用ALK抑制剂化合物或施用替代ALK抑制剂化合物，且

(c)如果存在突变I1268V或不存在突变，则将艾乐替尼施用于所述患者。