[发明专利]用于子宫腺肌症检测的生物标志物组合及其应用有效
申请号: | 201780047953.5 | 申请日: | 2017-08-07 |
公开(公告)号: | CN109689890B | 公开(公告)日: | 2022-03-25 |
发明(设计)人: | 贾慧珏;钟焕姿;宋晓蕾;王子榕;陈晨 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 彭家恩;彭愿洁 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 子宫 腺肌症 检测 生物 标志 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于子宫腺肌症检测或患病风险评估的生物标志物组合物,其特征在于:所述生物标志物组合物包括第一标志物组、第二标志物组和第三标志物组中的任一组或任两组;
所述第一标志物组由十八条核酸组成,十八条核酸分别为Seq ID No.1至Seq IDNo.18所示序列;
所述第二标志物组由二十二条核酸组成,二十二条核酸分别为Seq ID No.1、Seq IDNo.4、Seq ID No.5、Seq ID No.7、Seq ID No.10、Seq ID No.11、Seq ID No.13、Seq IDNo.15、Seq ID No.18至Seq ID No.31所示序列;
所述第三标志物组由十八条核酸组成,这十八条核酸分别为Seq ID No.1、Seq IDNo.2、Seq ID No.13、Seq ID No.19、Seq ID No.28、Seq ID No.32至Seq ID No.44所示序列。
2.根据权利要求1所述的生物标志物组合物,其特征在于:所述第一标志物组为CL标志物组,用于对来自阴道下1/3的样品进行子宫腺肌症检测或患病风险评估。
3.根据权利要求1所述的生物标志物组合物,其特征在于:所述第二标志物组为CU标志物组,用于对来自阴道后穹窿的样品进行子宫腺肌症检测或患病风险评估。
4.根据权利要求1所述的生物标志物组合物,其特征在于:所述第三标志物组为CV标志物组,用于对来自宫颈管的样品进行子宫腺肌症检测或患病风险评估。
5.根据权利要求1-4任一项所述的生物标志物组合物在制备子宫腺肌症检测或患病风险评估的试剂盒或检测工具中的应用。
6.一种制备子宫腺肌症生物标志物组合的方法,其特征在于:包括以下步骤,
(1)分别对子宫腺肌症病患和非病患进行生殖道内微生物样品采集,对所有采集的样品分别进行16S测序,所述生殖道内微生物样品采集,具体包括采集待测对象阴道下1/3样品、阴道后穹窿样品和宫颈管样品;
(2)将16S测序结果进行聚类分析,获得OTU单元以及每个OTU的种子序列,并计算每个OTU单元的相对丰度;
(3)利用随机森林模型对每个OTU单元的相对丰度与子宫腺肌症状态进行拟合,并进行5次十折交叉验证,得到最优的OTU组合,最优OTU组合中各OTU的种子序列,即组成子宫腺肌症的生物标志物组合。
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