[发明专利]用于子宫腺肌症检测的生物标志物组合及其应用有效

专利信息
申请号: 201780047953.5 申请日: 2017-08-07
公开(公告)号: CN109689890B 公开(公告)日: 2022-03-25
发明(设计)人: 贾慧珏;钟焕姿;宋晓蕾;王子榕;陈晨 申请(专利权)人: 深圳华大生命科学研究院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 彭家恩;彭愿洁
地址: 518083 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 用于 子宫 腺肌症 检测 生物 标志 组合 及其 应用
【说明书】:

提供用于子宫腺肌症检测或患病风险评估的生物标志物组合及应用。包括四十四条核酸中的至少一条,四十四条核酸分别为Seq ID No.1至Seq ID No.44所示序列,或者分别为与Seq ID No.1至Seq ID No.44所示序列具有97%以上相似性的序列。

技术领域

本申请涉及生物标志物领域,特别是涉及一种用于子宫腺肌症检测或患病风险评估的生物标志物组合及其应用。

背景技术

子宫腺肌症是子宫的内膜和腺体侵入了子宫肌层内引起的症状。正常情况下,子宫内膜应在子宫肌层下面,它们之间有界限分隔,当子宫内膜和表浅的肌肉层受到损伤,如分娩、多次人工流产和刮宫等,子宫内膜就会乘虚而入,它们在子宫肌层里生长发育,并刺激周围的肌细胞增生,形成子宫腺肌症。子宫肌层内的子宫内膜可以和正常的子宫内膜一样,随月经周期变化而出现周期性充血、水肿,甚至出血,引起强烈的子宫收缩而出现剧烈下腹痛,同时患者子宫均匀性增大、质硬、月经过多、经期过长,严重的会导致患者出现贫血。

目前子宫腺肌症的治疗方法主要有以下几种:1、手术切除子宫;2、保守手术治疗,3、中医调理治疗。三种治疗方法各有利弊。以前,子宫腺肌症多发生于40岁以上的经产妇,但近年来逐渐成年轻化趋势,这可能与剖宫产、人工流产等手术的增多有关。

临床上对子宫肌腺症的诊断,主要依赖症状、内诊和超音波检查。超音波扫描可以看见子宫整个肿大起来,子宫壁,尤其常见的是后壁,会超过二点五公分以上,如果超过二点五公分以上的厚度,几乎可以肯定为异常。假如有某一处聚集成一团,可能是肌瘤或腺瘤,也可用超音波辨别,因为腺瘤没有一层荚膜包在外围,而肌瘤则有,并且腺瘤的超音波回音比肌瘤强。另外,使用肿瘤指数CA125也可协助诊断。但是,以上方法都不能做到子宫腺肌症的早期检测或患病风险评估。

因此,寻找敏感、特异的子宫腺肌症的生物标志物是目前急需解决的问题。

发明内容

本申请的目的是提供一种用于子宫腺肌症检测或患病风险评估的生物标志物组合,及其在子宫腺肌症检测试剂盒、检测工具或药物筛选等方面的应用。

为了实现上述目的,本申请采用了以下技术方案:

本申请的一方面公开了一种用于子宫腺肌症检测或患病风险评估的生物标志物组合,该生物标志物组合包括四十四条核酸中的至少一条,四十四条核酸分别为Seq IDNo.1至Seq ID No.44所示序列,或者分别为与Seq ID No.1至Seq ID No.44所示序列具有97%以上相似性的序列。

需要说明的是,本申请的四十四条核酸是经过研究得出的,和子宫腺肌症有关联的核酸序列,其中每条核酸序列都与子宫腺肌症有关联性,因此,在不考虑判断准确性的情况下或者对此要求较低的情况下,可以单独或者组合用于子宫腺肌症检测或者患病风险评估。但是,本申请的一种优选方案中,不仅四十四条核酸一起使用,而且,还将四十四条核酸按照特定的规律进行分类,分成多个标志物组,各个标志物组一起用于子宫腺肌症检测或者患病风险评估,这将在后面的优选技术方案中详细描述。

还需要说明的是,本申请的四十四条核酸是根据97%以上相似性进行聚类分析,然后从每个分类单元(缩写OTU)中选取最具代表性的序列作为种子序列,其中与子宫腺肌症具有关联性的四十四个种子序列,即组成本申请的生物标志物组合;因此,本申请的生物标志物组合中,四十四条核酸不仅限于Seq ID No.1至Seq ID No.44所示序列,还可以是与Seq ID No.1至Seq ID No.44所示序列具有97%以上相似性的序列。

需要补充说明的是,本申请的用于子宫腺肌症检测或患病风险评估的生物标志物组合,并不是直接根据检测生物标志物组合的有或者无进行子宫腺肌症检测或患病风险评估的,而是,在检测到生物标志物组合后,通过随机森林模型进行判断,根据随机森林模型输出的概率判断待测对象是否患有子宫腺肌症或评估待测对象患子宫腺肌症的风险,这将在后面的技术方案中详细说明。

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