[发明专利]用于组表征的方法和系统

权利要求书

1.一种用于表征消化道相关病症组的系统，其中该消化道相关病症组与微生物有关的分类单位集合关联，所述系统包括：

●分类数据库，所述分类数据库包括针对与所述消化道相关病症组关联的所述分类单位集合的参考相对丰度范围集合；

●处理系统，所述处理系统能够操作以从用户收集包含生物材料的容器，所述处理系统包括能够操作以从所述生物材料确定所述用户的微生物序列数据集的测序仪系统；

●组表征系统，所述组表征系统能够操作以：

o基于所述微生物序列数据集确定针对所述用户的所述分类单位集合的用户相对丰度范围；

o生成所述用户相对丰度范围集合与所述参考相对丰度范围集合之间的比较；

o基于所述比较确定所述用户的所述消化道相关病症组的组表征；以及

●治疗系统，所述治疗系统能够操作以基于所述组表征促进针对所述消化道相关病症组的消化道相关病症的治疗。

2.权利要求1所述的系统，其中，所述分类数据库包括由以下项获得的所述参考相对丰度范围集合：

●确定与所述消化道相关病症组关联的分类单位的靶标集合，

●确定参考标志物集合；和

●确定基于所述参考标志物集合与所述分类单位的靶标集合之间的比较所选择的分类单位集合的所述参考相对丰度范围集合。

3.权利要求2所述的系统，其中，确定所述参考标志物集合包括基于预测读数确定所述参考标志物集合，所述预测读数从基于跨多个分类单位组共享的标志物特征所选择的引物组得到。

4.权利要求3所述的系统，其中，所述参考标志物集合与所述分类单位的靶标集合之间的比较包括所述预测读数与所述分类单位的靶标集合关联的参考微生物序列之间的序列相似性。

5.权利要求3所述的系统，其中，所述处理系统能够操作以基于使用所述引物组的引物扩增来自所述生物材料的核酸来确定所述微生物序列数据集，其中，所述引物靶向对应于与所述消化道相关病症关联的分类单位组的微生物序列，并且其中，所述分类单位集合包括分类单位组。

6.权利要求1所述的系统，其中，所述治疗系统能够操作以基于所述组表征有利于消耗品治疗的供应，其中，所述消耗品治疗能够操作以影响所述用户的与所述消化道相关病症关联的微生物群系组成和微生物群系功能中的至少一个，以促进所述消化道相关病症状态的改善。