[发明专利]由动量传递截面分布确定分子和分子组合体结构

权利要求书

1.一种用于确定分子的分子结构或分子组合体的分子结构的方法，所述方法包括：

[a]基于分子的路易斯结构，确定所述分子的多个候选分子结构，或[b]确定每个分子的多个候选分子组合体；

确定每个所述候选分子结构或候选分子组合体的预测时间分辨离子淌度质谱(TRIM-MS)光谱；

至少部分地基于所述分子或所述分子的所述分子组合体的测量的TRIM-MS光谱和每个所述预测TRIM-MS光谱之间的相似性度量，确定候选分子结构或候选分子组合体的子集；

确定所述子集中的每个候选分子结构或候选分子组合体的候选分数；以及

基于所述候选分数分配所述分子的分子结构或所述分子的分子组合体。

2.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述多个候选分子结构包括：

基于所述分子的所述路易斯结构，使用无偏构象搜索确定多个初始候选结构；

确定每个所述初始候选结构的离子化候选结构，其中每个所述离子化候选结构具有相同的电荷态；以及

通过在分子动力学模拟中放松每个所述离子化候选结构，确定每个所述离子化候选结构的所述候选分子结构。

3.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述多个候选分子组合体包括：

通过大分子对接算法将所述分子、一个或多个所述分子的组合体或其组合中的一个或多个彼此对接，以形成所述多个候选分子组合体。

4.根据权利要求1所述的方法，其中确定每个所述候选分子结构或每个所述候选分子组合体的所述预测TRIM-MS光谱包括：

确定每个所述候选分子结构或候选分子组合体的碰撞截面；和

基于所述碰撞截面，确定每个所述候选分子结构或候选分子组合体的所述预测TRIM-MS光谱。

5.根据权利要求4所述的方法，其中每个所述候选分子结构或每个所述候选分子组合体的所述碰撞截面由投影叠加逼近(PSA)或局部碰撞概率逼近(LCPA)确定。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述候选分子结构的子集或所述候选分子组合体的子集各自分别包括这样的候选分子结构或候选分子组合体，即当偏移δΩ值时，其对应的预测TRIM-MS光谱与所述测量的TRIM-MS光谱重叠。

7.根据权利要求1所述的方法，其中[a]确定所述子集中的每个候选分子结构的所述候选分数包括：

对于所述子集中的每个候选分子结构，确定每个原子-原子对的原子-原子距离概率分布；和

对于所述子集中的每个候选分子结构，通过基于每个原子-原子对的所述原子-原子距离概率分布的联合概率来确定所述候选分数；

和[b]确定所述子集中的每个候选分子组合体的所述候选分数包括：

将所述分子的所述分子组合体的所述测量的TRIM-MS光谱与每个所述预测TRIM-MS光谱交叉相关；或

确定所述子集中的每个候选分子组合体的概率排名。

8.根据权利要求1所述的方法，其中分配所述分子的所述分子结构或所述分子组合体的所述分子结构包括：

确定所述分子或所述分子组合体的所述分子结构是对应于最高排名候选分数的所述候选分子结构或所述候选分子组合体。

9.根据权利要求1所述的方法，还包括创建新的数据文件或更新所述分子的现有数据文件，所述数据文件包括：

所述分子的标识符；和

所述分子的所述分子结构或所述分子组合体的所述分子结构。

10.根据权利要求1所述的方法，还包括通过以下方法提供所述分子的所述分子结构或提供所述分子组合体的所述分子结构，所述方法包括：

显示所述分子或所述分子组合体的所述分子结构的图像、显示所述分子或所述分子组合体的所述分子结构的坐标、发送所述分子或所述分子组合体的所述分子结构的所述图像、发送所述分子或所述分子组合体的所述分子结构的所述坐标或其组合。