[发明专利]用于检测或定量丙型肝炎病毒的组合物和方法

权利要求书

1.一种包含至少第一和第二扩增寡聚物的组合物或试剂盒，其中：

所述第一扩增寡聚物包含含有SEQ ID NO:2的至少10个连续核苷酸并包括SEQ ID NO:2的位置5、7、12和15中的至少一个的靶杂交序列；和

所述第二扩增寡聚物包含含有SEQ ID NO:3的至少10个连续核苷酸并包括SEQ ID NO:3的位置5、7、12和15中的至少一个的靶杂交序列；和

所述第一和第二扩增寡聚物的靶杂交序列各自包含丙型肝炎病毒序列的至少约14个连续核苷酸。

2.根据权利要求1所述的组合物或试剂盒，其还包含第三扩增寡聚物，其中所述第三扩增寡聚物包含反义丙型肝炎病毒序列的至少约14个连续核苷酸，并配置成与HCV基因组位置78的下游特异性杂交。

3.一种检测样品中的丙型肝炎病毒核酸的方法，其包含：

使所述样品与至少第一、第二和第三扩增寡聚物接触，从而形成组合物，

在所述组合物中进行核酸扩增反应，其在丙型肝炎病毒核酸存在下产生一种或多种扩增子，

并且检测所述扩增子，

其中：

所述第一扩增寡聚物包含含有SEQ ID NO:2的至少10个连续核苷酸并包括SEQ ID NO:2的位置5、7、12和15中的至少一个的靶杂交序列；

所述第二扩增寡聚物包含含有SEQ ID NO:3的至少10个连续核苷酸并包括SEQ ID NO:3的位置5、7、12和15中的至少一个的靶杂交序列；

所述第三扩增寡聚物包含反义丙型肝炎病毒序列的至少约14个连续核苷酸，并配置成与HCV基因组位置78的下游特异性杂交；

所述第一和第二扩增寡聚物的靶杂交序列各自包含丙型肝炎病毒序列的至少约14个连续核苷酸；和

通过在所述丙型肝炎病毒核酸存在下延伸所述第一和第三扩增寡聚物或第二和第三扩增寡聚物产生所述一种或多种扩增子。

4.一种包含至少第一和第二捕获寡聚物的组合物或试剂盒，其中：

所述第一捕获寡聚物包含含有SEQ ID NO:54的至少10个连续核苷酸的靶杂交序列；和

所述第二捕获寡聚物包含含有SEQ ID NO:55的至少10个连续核苷酸的靶杂交序列；和

所述第一和第二捕获寡聚物的靶杂交序列各自包含丙型肝炎病毒序列的至少约14个连续核苷酸。

5.一种从样品中分离丙型肝炎病毒核酸的方法，其包含：

在允许第一和第二捕获寡聚物与所述丙型肝炎病毒核酸退火的条件下使所述样品与至少所述第一和第二捕获寡聚物接触，从而形成至少一种丙型肝炎病毒核酸和捕获寡聚物的复合物；

分离所述至少一种复合物，从而提供包含所述复合物的组合物；

其中：

所述第一捕获寡聚物包含含有SEQ ID NO:54的至少10个连续核苷酸的靶杂交序列；和

所述第二捕获寡聚物包含含有SEQ ID NO:55的至少10个连续核苷酸的靶杂交序列；和

所述第一和第二捕获寡聚物的靶杂交序列各自包含丙型肝炎病毒序列的至少约14个连续核苷酸。

6.根据前述权利要求中任一项所述的试剂盒、组合物或方法，其中所述组合物或试剂盒还包含初始扩增寡聚物，其包含SEQ ID NO:6的至少10个连续核苷酸。

7.根据前述权利要求中任一项所述的试剂盒、组合物或方法，其中所述组合物或试剂盒还包含探针寡聚物，其包含SEQ ID NO:13的至少10个连续核苷酸和丙型肝炎病毒序列的至少约14个连续核苷酸。

8.根据权利要求7所述的试剂盒、组合物或方法，其中所述初始扩增寡聚物和探针寡聚物与HCV核酸中的至少一个共同位置退火。