[发明专利]靶向非结构-结构转移位点的新药候选物质挖掘方法及新药候选物质挖掘装置

权利要求书

1.一种靶向非结构-结构转移位点的新药候选物质挖掘方法，其特征在于，上述方法作为程序存储在非暂时性计算机可读介质中并由计算机设备执行，上述方法包括：

计算机设备输入靶蛋白的氨基酸序列的步骤；

上述计算机装置利用生物信息学而确定靶蛋白的非结构-结构转移位点的步骤；

上述计算机装置对于化合物库中的所有化合物执行上述非结构-结构转移位点与选自所述化合物库的化合物之间的分子对接而在上述化合物库中选择与上述非结构-结构转移位点能够结合的第一候选化合物的步骤；

上述计算机装置执行对于选自上述第一候选化合物的化合物和上述非结构-结构转移位点的分子动力学模拟而在上述第一候选化合物中选择第二候选化合物的步骤，其中上述第二候选化合物是第一候选化合物中的与非结构-结构转移位点结合的位点的数量或结合能为基准值以上的化合物；以及

如果上述第二候选化合物与靶蛋白的结合力强于与其它候选蛋白质的结合力，则上述计算机设备将上述第二候选化合物确定为与上述靶蛋白相互作用的最终候选药物的步骤，

其中上述靶蛋白的非结构-结构转移位点包括在靶蛋白的氨基酸序列中具有连续增加的非结构分数的氨基酸序列，并且其中上述非结构分数是由输入非结构转移位点的氨基酸序列的程序预测的。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，

上述计算机装置使用分子对接程序而执行选自化合物库的化合物与上述非结构-结构转移位点的分子对接。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，将所述第二候选化合物确定为与所述靶蛋白相互作用的最终候选药物包括：

上述计算机装置以其它候选蛋白质的非结构位点为基准而确定具有上述第二候选蛋白质所结合可能性的其它候选蛋白质中的候选区域的步骤；

上述计算机装置以上述候选区域的氨基酸序列为基准而推断上述候选区域的蛋白质结构的步骤；以及，

上述计算机装置利用对接程序而确认上述候选区域的蛋白质结构与上述第二候选化合物的结合程度的步骤。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，其中推断所述候选区域的蛋白质结构包括：

上述计算机装置从存储已知蛋白的氨基酸序列和已知蛋白质结构的数据库通过将上述候选区域的氨基酸序列与所述数据库中的氨基酸序列相匹配而推断所述候选区域的蛋白质结构，或通过以上述候选区域的氨基酸序列为基准执行同源建模而推断所述蛋白质结构，通过将候选区域的氨基酸序列，估计蛋白质结构，或通过基于候选区域的氨基酸序列进行同源建模来估计蛋白质结构。