[发明专利]用于动脉粥样硬化性心血管疾病的生物标志物在审
申请号: | 201780094889.6 | 申请日: | 2017-09-13 |
公开(公告)号: | CN111108199A | 公开(公告)日: | 2020-05-05 |
发明(设计)人: | 揭著业;梁穗莎;夏慧华;贾慧珏 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6883 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 刘海罗 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 动脉粥样硬化 心血管疾病 生物 标志 | ||
1.一种生物标记物,其包括以下生物标记物1至3中的至少一种:
生物标记物1,其包含SEQ ID NOs:1-146中的至少一种多核苷酸,或其一个或多个特异性片段;
生物标记物2,其包含SEQ ID NOs:147-594中的至少一种多核苷酸,或其一个或多个特异性片段;和
生物标记物3,其包含SEQ ID NOs:595-1411中的至少一种多核苷酸,或其一个或多个特异性片段。
2.根据权利要求1所述的生物标志物,其中所述特异性片段为至少30bp,或至少40bp,或至少50bp,或至少60bp,或至少70bp,或至少80bp,或至少90bp,或至少100bp,或至少150bp,或至少200bp,或至少250bp,或至少300bp,或至少350bp,或至少400bp,或至少450bp,或至少500bp,或至少600bp,或至少700bp,或至少800bp,或至少900bp,或至少1000bp,或至少1500bp,或至少2000bp。
3.根据权利要求1所述的生物标志物,其中:
生物标记物1由SEQ ID NOs:1-146的多核苷酸组成;
生物标记物2由SEQ ID NOs:147-594的多核苷酸组成;和/或
生物标记物3由SEQ ID NOs:595-1411的多核苷酸组成。
4.根据权利要求1-3中任一权利要求所述的生物标志物,其包括生物标志物1、生物标志物2和生物标志物3。
5.根据权利要求1-5中任一权利要求所述的生物标志物,其包含与生物标志物1、生物标志物2或/和生物标志物3的多核苷酸序列具有至少85%序列同一性的多核苷酸。
6.一种生物标志物组合物,其包含至少一种权利要求1-5中所述的生物标志物,任选地,还包含药学上可接受的赋形剂,例如溶剂或缓冲剂。
7.根据权利要求1-5中任一权利要求所述的生物标志物或权利要求6所述的生物标志物组合物,其用于获得所述受试者患有ACVD的概率,或用于诊断所述受试者是否患有与ACVD有关的异常状况或处于发展与ACVD有关的异常状况的风险中,或用于所述ACVD患者的预后评估,或用于所述ACVD患者的治疗监测以检测对治疗的反应。
8.根据权利要求1-5中任一权利要求所述的生物标记物在制备药物或试剂盒中的用途,所述药物或试剂盒用于获得所述受试者患有ACVD的概率,或用于诊断所述受试者是否患有与ACVD有关的异常状况或处于发展与ACVD有关的异常状况的风险中,或用于所述ACVD患者的预后评估,或用于所述ACVD患者的治疗监测以检测对治疗的反应。
9.一种方法,其用于获得受试者患有ACVD的概率,或用于诊断受试者是否患有与ACVD有关的异常状况或处于发展与ACVD有关的异常状况的风险中,或用于ACVD患者的预后评估,或用于ACVD患者的治疗监测以检测对治疗的反应,包括以下步骤:
(1)确定受试者样品中的唾液乳杆菌(Lactobacillus salivarius)如唾液乳杆菌ACS-116-V-Col5a的相对丰度;
优选地,进一步包括以下步骤:
(2)基于样品中唾液乳杆菌(Lactobacillus salivarius)的相对丰度和训练数据集获得受试者患有ACVD的概率。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述ACVD为冠心病(CHD)、脑血管疾病、外周动脉疾病或主动脉粥样硬化疾病。
11.根据权利要求9所述的方法,其中所述样品是粪便样品。
12.根据权利要求9所述的方法,其中在步骤(2)中,所述训练数据集是根据多个患有ACVD的受试者和多个正常受试者的唾液乳杆菌的相对丰度构建的。
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