[发明专利]一种检测结直肠癌易感基因突变的试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 201810003667.5 | 申请日: | 2018-01-03 |
公开(公告)号: | CN107988372A | 公开(公告)日: | 2018-05-04 |
发明(设计)人: | 郎秋蕾;周小川;林彬;李璐璐;王其成;潘石玄伟 | 申请(专利权)人: | 杭州联川基因诊断技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
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地址: | 310018 浙江省杭州市下沙经济*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 直肠癌 基因突变 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一组检测结直肠癌易感基因突变的引物,其特征在于,包含通用性引物和特异性引物。
2.根据权利要求1所述的引物,其特征在于,所述的通用性引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
3.根据权利要求1所述的引物,其特征在于,所述的特异性引物包括:
用于扩增PIK3CA基因突变位点的特异性引物核苷酸序列如SEQ ID NO.3~6所示;
用于扩增BRAF基因突变位点的特异性引物核苷酸序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示;
用于扩增KRAS基因突变位点的特异性引物核苷酸序列如SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10所示。
4.根据权利要求1所述的引物,其特征在于,所述的特异性引物可以被硫代修饰、2-氟代核糖核酸修饰、2'-O-甲基核糖核酸修饰、5-甲基脱氧胞嘧啶修饰、脱氧次黄嘌呤修饰、2-氨基嘌呤修饰、5-溴-脱氧尿嘧啶修饰、反向dT修饰、双脱氧胞苷修饰、间臂修饰、氨基修饰、巯基修饰、磷酸化修饰、生物素修饰、锁核苷酸修饰中的任意一种方式修饰,也可以是多种方式同时修饰。
5.一种检测结直肠癌易感基因突变的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1-4中任一项所述的引物。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR混合反应液、纯化磁珠和阳性对照。
7.根据权利要求5-6中任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述的PCR混合反应液包括DNA聚合酶、dNTPs和2×PCR缓冲液。
8.一种非疾病诊断目的的检测结直肠癌易感基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:提取待测样本的基因组DNA,特异性引物与模板基因组DNA序列结合、通用引物扩增待测样本目标区域,磁珠纯化文库,对得到的文库进行高通量测序并分析结直肠癌易感基因的突变。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述待测样品为组织切片、石蜡包埋组织和血浆中的一种或多种。
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