[发明专利]一种单细胞甲基化测序文库的构建方法及其应用在审
申请号: | 201810006282.4 | 申请日: | 2018-01-02 |
公开(公告)号: | CN107904669A | 公开(公告)日: | 2018-04-13 |
发明(设计)人: | 李响;严建兵;陈露 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/6869;C12Q1/6858 |
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地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 单细胞 甲基化 序文 构建 方法 及其 应用 | ||
1.一种单细胞全基因组甲基化测序的文库构建方法,该方法包括如下步骤:
1)单细胞转化DNA的获得;
2)DNA的富集;
3)富集DNA的建库。
2.权利要求1所述的方法,其中步骤1)进一步包括如下步骤:①分离单个细胞或细胞核;②将单细胞或细胞核进行裂解,得到单细胞样本;③将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶;④纯化产物DNA片段。
3.权利要求1所述的方法,其中步骤2)进一步包括如下步骤:⑤短片段富集合成反应;⑥磁珠纯化并去除单链引物;⑦酶连反应;⑧多重置换扩增(MDA);⑨磁珠纯化。
4.权利要求1所述的方法,其中步骤3)进一步包括如下步骤:⑩扩增产物浓度测定;基于Tn5的DNA测序文库的构建;文库纯化与片段分选。
5.权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的单细胞来源于植物、微生物或动物。
6.权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的单细胞来源优选植物。
7.权利要求6所述的方法,其特征在于,所述的植物优选玉米。
8.权利要求2所述的方法,其特征在于,所述的步骤①中以27%的山梨醇溶液平衡胞内渗透压,维持正常的细胞形态。
9.权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的步骤⑤用不含标签的随机序列作为引物。
10.权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的步骤⑦为利用高温将配对双链变性,再将单链小片段连接成单链长片段。
11.权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的步骤⑧将MDA的扩增方法引入了重亚硫酸盐测序的检测方法。
12.根据权利要求11所述的方法,其特征在于,所述的MDA扩增方法利用不含标签的5’末端生物素修饰的随机序列作为引物。
13.根据权利要求11所述的方法,其特征在于,所述的MDA扩增试剂混匀后需要30℃孵育2.5小时。
14.权利要求3所述的步骤,其特征在于,所述的步骤⑤和步骤⑧所用引物序列的碱基数目优选9个。
15.权利要求1所述的方法在单细胞甲基化检测中的应用。
16.权利要求1所述的方法在甲基化测序试剂盒构建中的应用。
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