[发明专利]环状RNA‑DGKB在垂体腺瘤生物标记中应用及表达在审
申请号: | 201810009208.8 | 申请日: | 2018-01-04 |
公开(公告)号: | CN107937547A | 公开(公告)日: | 2018-04-20 |
发明(设计)人: | 张波;李欣宇;娄佳成;王翔;吕逸竹;郝宇超 | 申请(专利权)人: | 大连医科大学附属第二医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京律远专利代理事务所(普通合伙)11574 | 代理人: | 丁清鹏 |
地址: | 116021 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环状 rna dgkb 垂体 腺瘤 生物 标记 应用 表达 | ||
1.环状RNA-DGKB在垂体腺瘤生物标记中应用,其特征在于:circRNA-DGKB长401bp,位于人类的第7条染色体上14647058到14712652,DGKB是该环状RNA的覆盖基因,所述的RNA-DGKB碱基序列如SEQIDNO:1所示。
2.如权利要求1所述的应用,包括检测来自所述对象的垂体腺瘤组织样本中circRNA-DGKB的量,其中较高量的circRNA-DGKB为所述对象垂体腺瘤侵袭性强,并与所述对象预后不良可能性增加有关。
3.环状RNA-DGKB在垂体腺瘤生物标记中的表达,其特征在于:具体的表达方法包含以下步骤:
步骤一、侵袭性和非侵袭性垂体腺瘤组织RNA提取;
步骤二、总RNA反转录cDNA;
步骤三、将cDNA进行定时定量PCR检测,反应结束后检测样品中circRNA-DGKB的PCR识别序列,然后与PCR产物序列结果进行对比可知circRNA-DGKB在垂体腺瘤组织中进行表达。
4.根据权利要求3的表达方法,其特征在于:所述的步骤一中侵袭性和非侵袭性垂体腺瘤组织RNA提取方法是相同的,具体提取方法为:称取2克组织材料,加入250微升RNAiso Plus,手持电动器研磨后,转移至1.5毫升RNase-free的离心管中,12000转4℃离心10分钟,去上清200微升加入1.5毫升RNase-free的离心管中,加入1毫升RNAiso Plus新混匀后室温静置5分钟,加入200微升的氯仿,充分混匀后,室温静置3分钟,12000转4℃离心15分钟,取上清250ul,加入500微升异丙醇混匀后室温静置10分钟,12000转4℃离心10分钟。弃掉上清,加入75%乙醇,颠倒混匀后,7500转4℃离心5分钟,弃掉上清,室温静置5分钟,加入15-20微升Nuclease-Free water溶解,Nanodrop测算所得液体的OD值及浓度。
5.根据权利要求3的表达方法,其特征在于:所述的步骤二中总RNA反转录cDNA的方法为:按照反转录试剂盒PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser说明,加入1微克RNA进行基因组DNA的去除,具体加入DNA酶、反应缓冲液及Nuclease-Free水补齐10微升反应体系,PCR仪42℃孵育2分钟。而后进行反转录,具体加入反转录所需的随机引物,缓冲液、反转录酶及Nuclease-Free水补齐20微升反应体系,PCR仪37℃孵育15分钟,85℃孵育30秒,4℃保温,将反转录产物1∶10稀释,在冰上制备qPCR混合物。
6.根据权利要求3的表达方法,其特征在于所述的步骤三中将cDNA进行定时定量PCR检测反应条件如下:首先95℃下预变性30秒,然后95℃变性5秒,56℃退火30秒,72℃延伸30秒,40个循环,热融解阶段95℃下变性60秒,56℃下热融解30秒,95℃热融解30秒。
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