[发明专利]耳聋基因检测试剂盒及其产前无创耳聋基因检测方法在审
申请号: | 201810096962.X | 申请日: | 2018-01-31 |
公开(公告)号: | CN108018352A | 公开(公告)日: | 2018-05-11 |
发明(设计)人: | 付晶;任文静;石坚 | 申请(专利权)人: | 领航基因科技(杭州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 无锡市汇诚永信专利代理事务所(普通合伙) 32260 | 代理人: | 张欢勇 |
地址: | 310000 浙江省杭州市江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 耳聋 基因 检测 试剂盒 及其 产前 方法 | ||
1.一耳聋基因检测试剂盒,被适用于检测GJB3基因位点(c.538C>T),GJB2基因位点(c.235delC,c.299_300delAT,c.176_191del16,c.35delG),线粒体DNA位点(m.1555A>G,m.1494C>T),SLC26A4基因位点(c.919-2A>G,c.2168A>G)的一种或其组合,其中发生突变的基因被定义为一突变基因,没有发生突变的基因被定义为一野生基因,其特征在于,所述耳聋基因检测试剂盒包括:
扩增基因位点的引物,对应所述引物的探针,以及混合液;以及
其中所述引物具有至少一组如引物名称:GF1到GF9,GR1到GR9所示的序列,所述探针对应地具有至少一组如探针名称:P1-P18所示的序列,每一序列探针包括野生型探针以及突变型探针。
2.根据权利要求1所述的耳聋基因检测试剂盒,其特征在于,其中所述野生型探针的5’端修饰荧光基团与所述突变型探针的5’端修饰荧光基团不同。
3.根据权利要求2所述的耳聋基因检测试剂盒,其特征在于,其中所述野生型探针和所述突变型探针的3’端修饰淬灭基团为MGB、BHQ等荧光淬灭基团中的一种。
4.根据权利要求1所述的耳聋基因检测试剂盒,其特征在于,所述样品为孕妇外周血中的游离DNA。
5.根据权利要求4所述的耳聋基因检测试剂盒,其特征在于,所述耳聋基因检测试剂盒进一步包括空白质控品,阴性质控品以及阳性质控品,其中所述空白质控品被实施为无菌水。
6.根据权利要求5所述的耳聋基因检测试剂盒,其特征在于,所述阴性质控品被实施为所述野生基因,所述阳性质控品被实施为所述突变基因和所述野生基因的1:1混合物。
7.根据权利要求1到6任一所述的耳聋基因检测试剂盒,其特征在于,所述引物GF1和GR1以及所述探针P1和P2被用于扩增和检测c.235delC位点;
所述引物GF2和GR2以及所述探针P3和P4被用于扩增和检测
c.299_300delAT位点;所述引物GF3和GR3以及所述探针P5和P6被用于扩增和检测c.176_191del16位点;所述引物GF4和GR4以及所述探针P7和P8用于扩增和检测c.35delG位点;所述引物GF5和GR5以及探针P9和P10用于扩增和检测c.919-2A>G位点;所述引物GF6和GR6以及探针P11和P12用于扩增和检测c.2168A>G位点;所述引物GF7和GR7以及探针P13和P14被用于扩增和检测m.1555A>G位点;所述引物GF8和GR8以及探针P15和P16用于扩增和检测m.1494C>T位点;所述引物GF9和GR9以及探针P17和P18被用于扩增和检测c.538C>T位点。
8.一产前无创耳聋基因检测方法,被适用于检测GJB3基因位点(c.538C>T),GJB2基因位点(c.235delC,c.299_300delAT,c.176_191del16,c.35delG),线粒体DNA位点(m.1555A>G,m.1494C>T),SLC26A4基因位点(c.919-2A>G,c.2168A>G)的一种或其组合,其中发生突变的基因被定义为一突变基因,没有发生突变的基因被定义为一野生基因,包括以下步骤:
S1:获取样品基因,其中所述样品基因被实施为孕妇外周血中的游离DNA;
S2:分装检测液,其中所述检测液包括针对所述样品基因的引物,探针以及混合液,其中所述探针包括野生探针以及突变探针;
S3:添加所述样品基因至一检测液中形成一检测反应液,添加对应的质控品至另一检测液中形成一对照反应液;
S4:扩增所述检测反应液以及所述对照反应液;以及
S5:以数字PCR技术分析所述检测反应液以及所述对照反应液,计算所述样品基因中所述突变基因与所述野生基因的比例。
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