[发明专利]一种预测食管鳞状细胞癌预后的生物标志物有效
申请号: | 201810115240.4 | 申请日: | 2018-02-06 |
公开(公告)号: | CN108315414B | 公开(公告)日: | 2019-11-29 |
发明(设计)人: | 许晶;于跃;吴卫兵;陈亮;朱全;阙军;王俊;闻伟;潘相龙;徐心峰;曹靖 | 申请(专利权)人: | 江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院) |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G16B20/10;G16B20/00 |
代理公司: | 11467 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 | 代理人: | 王斌<国际申请>=<国际公布>=<进入国 |
地址: | 210000 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 食管鳞状细胞癌 生物标志物 预后标志物 预后 预测 预后预测 侵袭和转移 临床信息 癌组织 大数据 高表达 基因 体外 增殖 增高 蛋白 体内 验证 发现 筛选 研究 检测 联合 | ||
1.一种ANO1联合MMP3制备预测食管鳞状细胞癌预后的生物标志物的应用,其特征在于所述的AN01和MMP3为基因或其表达的蛋白;其中所述ANO1基因为人第11号染色体的70078302-70189545位,MMP3基因为人第11染色体的102835797 -102843689位。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于所述的ANO1和MMP3是通过公共大数据的预后标志物的筛选、预后标志物的验证和预后标志物的效力检测获得,其中所述基于公共大数据的预后标志物的筛选包括以下步骤:
(1)检索GEO数据库,搜索同一食管鳞状细胞癌患者队列组织样本的DNA测序及RNA芯片数据;
(2)寻找同时满足在DNA水平基因拷贝数变异频发及mRNA水平癌与癌旁组织表达显著差异的基因,获得两个候选基因ANO1、MMP3。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于所述的预后标志物的检测包括组织芯片的构建和ANO1、MMP3基因表达检测,所述组织芯片的构建包括利用苏木精-伊红染色切片选择有代表性的组织区域和利用亲和素-生物素复合物法进行免疫组化分析。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于所述代表性的组织区域包括癌组织和癌旁组织,所述癌组织中癌细胞>80%,所述癌旁组织中不含癌细胞。
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