[发明专利]小麦黄条纹病毒及其NASH检测方法、检测试剂盒有效
申请号: | 201810135714.1 | 申请日: | 2018-02-09 |
公开(公告)号: | CN108315337B | 公开(公告)日: | 2021-06-25 |
发明(设计)人: | 刘艳;杜真真;王锡锋 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12N15/40 | 分类号: | C12N15/40;C12Q1/70;C12Q1/6811;C12Q1/6834;C12Q1/6804;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 北京兆君联合知识产权代理事务所(普通合伙) 11333 | 代理人: | 胡敬红 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 小麦 条纹 病毒 及其 nash 检测 方法 试剂盒 | ||
1.小麦黄条纹病毒(Wheat yellow striate virus, WYSV)基因组序列,该序列如SEQID NO.3所示。
2.一种用于权利要求1所述小麦黄条纹病毒(Wheat yellow striate virus, WYSV)的核酸斑点杂交检测方法,包括如下步骤:
(1)重组质粒的获得:所述的重组质粒是含WYSV部分基因目的片段的pMD -18T重组载体;所述的重组载体是通过WYSV特异性引物对以反转录PCR扩增获得的PCR产物,纯化后连接至pMD -18T载体上,转化至DH 5α大肠杆菌感受态中;所述WYSV特异性引物对为:
SEQ ID NO.1:5’ ggtgctcagtgtcgctttct -3’;
SEQ ID NO.2:5’ acctgctgttccattcttgtc -3;
(2)地高辛标记探针的制备:所述探针为以地高辛为标记物通过PCR法制得的DNA探针,所述制备探针的PCR体系中总体积25 μL,其中0.5 μL重组质粒、2 μL浓度为2.5 mM的DIG-dNTPs、0.2 μL rTaq以及浓度为10 μmol/L的WYSV特异性引物对各0.5μL,
在制备探针的PCR体系反应液中,包含有如下一对特异性引物对,其核苷酸序列为:
SEQ ID NO.1:5’ ggtgctcagtgtcgctttct -3’;
SEQ ID NO.2:5’ acctgctgttccattcttgtc -3’;
(3)通过点样和杂交进行NASH检测:
将待测总RNA样品点于硝酸纤维素尼龙膜上,加入杂交缓冲液进行预杂交;将步骤(2)中制备的地高辛标记探针加入杂交缓冲液中杂交,再免疫显色。
3.根据权利要求2所述的检测方法,所述步骤(1)中PCR扩增反应条件为:94℃ 3 min,94℃ 30 s、56℃ 45 s 和72℃90 s共35 个循环,72℃ 10 min。
4.权利要求2-3任一所述的检测方法在检测感病农作物植株体内WYSV病毒中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,所述农作物为小麦,大麦或燕麦。
6.一种用于检测 WYSV病毒的试剂盒,该试剂盒包括有: PCR体系反应液、NASH反应试剂、硝酸纤维素膜和杂交袋;所述的NASH反应试剂由以下组分组成:
SDS: 10%w/v
封闭液: 封闭剂用Buffer1稀释到10%
洗涤液: Buffer1+0.3%w/v Tween-20
Buffer 1: 0.1M Maleic acid,0.15M NaCl,pH7.5
Buffer 2: 将封闭液用Buffer 1稀释10倍
Buffer 3: 100mMTris-HCl,100mMNaCl,pH9.5
Buffer 4: 10mMTris-HCl,1mM EDTA,pH8.0
NBI/CBIP: 10mL
显色底物溶液: 200μL NBT/BCIP加入10mL Buffer3中
杂交缓冲液: 5×SSC,2%w/v封闭液,0.02%w/v SDS, 0.1%w/v N-lauroylsarcosine, 50%甲酰胺
AP-DIG抗体: 50μL
20×SSC溶液: 3MNaCl,0.3M Na-citrate, pH7.0,实验中所需的0.5×SSC、2×SSC、5×SSC溶液由20×SSC做相应稀释;
所述PCR体系反应液中含WYSV特异性引物对,其序列如下:
SEQ ID NO.1:5’ ggtgctcagtgtcgctttct -3’;
SEQ ID NO.2:5’ acctgctgttccattcttgtc -3;
通过PCR体系反应得到地高辛标记探针。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,所述试剂盒中还包括WYSV阳性对照样品和阴性对照样品。
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