[发明专利]检测猕猴桃溃疡病原菌的引物及其检测方法和应用在审
申请号: | 201810138685.4 | 申请日: | 2018-02-10 |
公开(公告)号: | CN108315448A | 公开(公告)日: | 2018-07-24 |
发明(设计)人: | 石军;胡容平;黄廷友;刘定友;项祖芬;侍守佩;彭涛;李春财;杨伟;张杰 | 申请(专利权)人: | 绵阳市农业科学研究院;四川省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/38 |
代理公司: | 成都帝鹏知识产权代理事务所(普通合伙) 51265 | 代理人: | 黎照西 |
地址: | 621000*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病原菌 检测 特异性引物 反向引物 正向引物 猕猴桃 溃疡 灵敏性 引物 应用 | ||
1.一种高灵敏性检测猕猴桃溃疡病原菌Pseudomonas syringae pv.actinidae的一组特异性引物,其特征在于,所述一组特异性引物由正向引物和反向引物组成,所述正向引物为:5'-AAAACCGCTGTGATACAATTCG-3',如SEQ ID NO.1所示,所述反向引物为:5'-GATAGCCCTGAATGGTTTCCGAA-3',如SEQ ID NO.2所示;所述一组特异性引物的检测灵敏度为1pg菌体DNA。
2.一种猕猴桃溃疡病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的高灵敏度检测方法,其特征在于,所述方法包括步骤:
(1)从待检测猕猴桃果品中提取DNA;
(2)以步骤(1)所得DNA为PCR模板DNA,进行PCR扩增;
(3)用琼脂糖凝胶电泳检测步骤(2)所得扩增产物,如产生目标大小条带,则证明猕猴桃果品感染溃疡病;
步骤(2)中,进行所述PCR扩增时,所用的引物由正向引物和反向引物组成,所述正向引物为:5'-AAAACCGCTGTGATACAATTCG-3',如SEQ ID NO.1所示,所述反向引物为:5'-GATAGCCCTGAATGGTTTCCGAA-3',如SEQ ID NO.2所示。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,提取DNA的方法为CTAB法。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述CTAB法的步骤为:
1)取适量的猕猴桃果品放入1.5ml EP管中,加入液氮后,用研磨棒快速研磨成粉末;
2)加入550μL 65℃预热的CTAB提取液,剧烈振荡后,放于65℃恒温箱中1h,其间每间隔10min振荡混匀一次;
3)加入550μL氯仿-异戊醇(24:1v/v),剧烈震荡并充分混匀,静置10min,于13000r/min转速下离心5min;
4)取上清,加入600μL冰乙醇,于13000r/min转速下离心5min,倒掉上清,用75%乙醇冲洗沉淀;重复该步骤至少1次;
5)于7500r/min转速下空离心3min,用移液器吸去底部多余的液体,放于室温自然干燥;
6)干燥后,加入适量的灭菌ddH2O充分溶解,然后保存于-20℃备用。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,进行所述PCR扩增时,所用的PCR反应体系包括10×PCR buffer、dNTP Mixture、模板DNA、Ex Taq、ddH2O和所述引物。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述PCR反应体系为:PCR模板DNA:1.0μL、2.0mM的dNTP Mixture:2.0μL、10×PCR buffer:2.0μL、10mM的正向引物:0.5μL、10mM的反向引物:0.5μL、5units/μL的Ex Taq:0.1μL、加入ddH2O至PCR反应体系体积为20μL。
7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的程序为:
1)于94℃进行模板DNA的预变性反应,反应时间为4min;
2)于94℃进行模板DNA的变性反应,反应时间为30s;
3)于60℃进行退火,时间为30s;
4)于72℃下进行延伸,时间为1min;
5)循环步骤1)~4)30次;
6)于72℃延伸5min;
7)对扩增产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳成像分析。
8.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述条带的位置为730bp处。
9.权利要求2~7任一项所述方法在检测由Pseudomonas syringae pv.actinidae引起的猕猴桃溃疡病上的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述应用包括对猕猴桃种苗检疫、土壤病原菌检测、猕猴桃溃疡病早期病害诊断以及Pseudomonas syringaepv.actinidae的检测和鉴定。
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