[发明专利]检测猕猴桃溃疡病原菌的引物及其检测方法和应用在审
申请号: | 201810138685.4 | 申请日: | 2018-02-10 |
公开(公告)号: | CN108315448A | 公开(公告)日: | 2018-07-24 |
发明(设计)人: | 石军;胡容平;黄廷友;刘定友;项祖芬;侍守佩;彭涛;李春财;杨伟;张杰 | 申请(专利权)人: | 绵阳市农业科学研究院;四川省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/38 |
代理公司: | 成都帝鹏知识产权代理事务所(普通合伙) 51265 | 代理人: | 黎照西 |
地址: | 621000*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病原菌 检测 特异性引物 反向引物 正向引物 猕猴桃 溃疡 灵敏性 引物 应用 | ||
本发明提供一种高灵敏性检测猕猴桃溃疡病原菌Pseudomonas syringae pv.actinidae的一组特异性引物,其正向引物和反向引物组成,所述正向引物为:5'‑AAAACCGCTGTGATACAATTCG‑3',如SEQ ID NO.1所示,所述反向引物为:5'‑GATAGCCCTGAATGGTTTCCGAA‑3',如SEQ ID NO.2所示。本发明还提供了基于该特异性引物的检测方法和应用。
技术领域
本发明属于农业及植物检疫技术领域,具体涉及用于检测猕猴桃溃疡病原菌Pseudomonas syringae pv.actinidae的高灵敏度特异性引物及检测方法和应用。
背景技术
猕猴桃被称为水果之王和维生素C之冠,具有较高的经济效益,国内的主要种植区有四川、陕西和贵州等地。对于猕猴桃病害的检测、防控,是提高其经济价值,促进地区猕猴桃行业经济发展的必要手段。
溃疡病是一种严重威胁猕猴桃生产的致命性细菌性病害,被列为全国森林植物检疫对象。丁香假单胞菌是猕猴桃病害的主要病原菌,目前认定主要病原菌之一是猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.Actinidiae,Psa)。该病原菌在6月中旬至9月底有很高的产孢能力,当猕猴桃幼果感染该菌时,会严重影响果实的生长,在6月感染时,容易发生采前落果。该病原菌对于果底部和果中部均有较强的侵染能力。
利用特异性引物检测病原菌仅通过PCR扩増结果便可以实现病原苗的鉴定,其具有简便快捷的优点,在病害早期诊断和及时防治领域中得到了广泛的应用。目前,对于猕猴桃溃疡病菌的PCR检测方面,现有技术也进行了一些有益尝试,如申请号为201610230023.0的中国专利提供了一种检测方法,避免了常规PCR方法出现的假阳性问题,并缩短了检测时间。
在实际检测工作中,除了对引物有特异性要求之外,还要求引物具有高度的敏感性。引物的特异性可以保证对具体病原菌检测的准确性,而敏感性可以更易于病原菌的精确检测,可在低含量下检出病原菌,更利于病害初期的诊断。然而,据发明人所知,在这方面的研究仍处于空白。
发明内容
针对现有技术的缺点,本发明的目的之一在于提供一种高灵敏性检测猕猴桃溃疡病原菌Pseudomonas syringae pv.actinidae的一组特异性引物,所述一组特异性引物由正向引物和反向引物组成,所述正向引物为:5'-AAAACCGCTGTGATACAATTCG-3',如SEQ IDNO.1所示,所述反向引物为:5'-GATAGCCCTGAATGGTTTCCGAA-3',如SEQ ID NO.2所示;
所述一组特异性引物的检测灵敏度为1pg菌体DNA。
本发明的另一个目的在于提供一种猕猴桃溃疡病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的高灵敏度检测方法,所述方法包括步骤:
(1)从待检测猕猴桃果品中提取DNA;
(2)以步骤(1)所得DNA为PCR模板DNA,进行PCR扩增;
(3)用琼脂糖凝胶电泳检测步骤(2)所得扩增产物,如产生目标大小条带,则证明猕猴桃果品感染溃疡病;
步骤(2)中,进行所述PCR扩增时,所用的引物由正向引物和反向引物组成,所述正向引物为:5'-AAAACCGCTGTGATACAATTCG-3',如SEQ ID NO.1所示,所述反向引物为:5'-GATAGCCCTGAATGGTTTCCGAA-3',如SEQ ID NO.2所示。
在实际检测工作中,步骤(3)中,所述条带的位置为730bp处。
一般情况下,步骤(1)中,可选的提取DNA的方法为CTAB法。
具体到本发明而言,所述CTAB法可以具体以下述步骤进行:
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