[发明专利]用于鉴定辣椒熟性的InDel分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 201810146800.2 申请日: 2018-02-12
公开(公告)号: CN108165653B 公开(公告)日: 2020-11-06
发明(设计)人: 袁欣捷;陈学军;方荣;周坤华 申请(专利权)人: 江西省农业科学院蔬菜花卉研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王文君;黄爽
地址: 330200 江西*** 国省代码: 江西;36
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摘要:
搜索关键词: 用于 鉴定 辣椒 indel 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.用于鉴定辣椒熟性的InDel分子标记的引物在鉴定辣椒熟性中的应用;

所述InDel分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;

所述引物包括正向引物FFN1-5UF5、反向引物FFN1-e1R1和反向引物FFN1-PA-R,序列分别如SEQ ID NO:1-3所示;

包括以下步骤:

1)提取待测辣椒的基因组DNA;

2)以待测辣椒的基因组DNA为模板,利用SEQ ID NO:1-3所示引物,进行PCR扩增反应;

3)分析PCR扩增产物;

步骤3)采用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物:如果扩增结果出现一条为830 bp的特征条带,则判定待测辣椒为早熟材料;如果扩增结果出现一条为380 bp的特征条带,则判定待测辣椒为具有纯合基因型的晚熟材料;如果扩增结果出现830 bp和380 bp两条特征条带,则判定待测辣椒为具有杂合基因型的晚熟材料;

其中,始花节位为1-4节的为早熟辣椒;始花节位大于4节的为晚熟辣椒。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,步骤2)中PCR扩增反应使用的反应体系为:2×Es Taq MasterMix 5 μL,10 μM正向引物FFN1-5UF5和10 μM反向引物FFN1-e1R1各0.08μL,10 μM反向引物FFN1-PA-R 0.4 μL,80-200 ng/μL DNA模板0.6 μL,ddH2O 3.84 μL。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,步骤2)PCR反应程序:95℃预变性2 min;95℃变性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸40 s,38个循环;72℃延伸10 min。

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