[发明专利]检测食品中产气荚膜梭菌和gyrA基因的引物、试剂盒和方法在审
申请号: | 201810176257.0 | 申请日: | 2018-03-02 |
公开(公告)号: | CN108315449A | 公开(公告)日: | 2018-07-24 |
发明(设计)人: | 吴冰;蔡先全;李蓉;邱德义 | 申请(专利权)人: | 蔡先全 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/145 |
代理公司: | 中山市兴华粤专利代理有限公司 44345 | 代理人: | 吴剑锋 |
地址: | 528400*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荚膜梭菌 引物 试剂盒 上游引物 下游引物 探针 检测 试剂盒检测 检测结果 探针序列 种检测 配比 | ||
1.一种检测食品中产气荚膜梭菌及gyrA基因的引物,其特征在于该引物和探针组合的序列分别为:
上游引物recAF:tgggagattctcacgttggtc
下游引物recAR:gcttgcttaaatggaggagca
探针recAP:acaacaccaggtggtagagcgt
上游引物gyrAF:tggtgaggaaaaagaaccagt
下游引物gyrAR:tgtgtcttgcatttttgtgtgt
探针gyrAP:ggaccagatttccctacagcagga。
2.一种检测食品中产气荚膜梭菌及gyrA基因的数字PCR检测试剂盒,其特征在于该试剂盒中20.0μL反应体系包括以下组分:其中2×ddPCR Super Mix 10.0μL,上、下游引物各1.0μL、探针各1.0μL,DNA模板4.0μL。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于所述的上游引物recAF与上游引物gyrAF的含量比例为0.1-1:1。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于所述的下游引物recAR与下游引物gyrAR的含量比例为0.1-1:1。
5.一种检测食品中产气荚膜梭菌及gyrA基因的方法,其特征在于包括以下步骤:
A、提取样品DNA;
B、将各反应组分加入如权利要求2所述的20.0μl反应体系,然后加入70.0μl矿物油,混匀后转移到微滴发生器上自动产生微滴;同时分别取所述试剂盒中的阳性质控、和阴性质控,按照与步骤A相同的方法处理,得到相应的DNA模板;
C、将制备数字PCR混合液制作为油包水PCR微反应,并全部转移到96孔反应板PCR反应管中;再将96孔反应板在封膜仪上封膜,并置于普通PCR仪进行PCR反应;
D、打开微滴荧光检测器应用软件,将PCR反应结束后的96孔反应板直接插入设备,检测每PCR反应管中微滴的PCR反应情况,最后根据珀松分布定律算出待测基因的拷贝数。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于步骤C中PCR扩增的反应程序按以下步骤进行:
(1)94℃预变性3min;
(2)94℃变性10s,57.6℃退火1min,共进行40个循环;
(3)98℃酶热失活10min;
(4)4℃停止反应。
7.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于步骤A所述的提取样品DNA:挑取经可疑的单个菌落,加入200μl灭菌重蒸水中,制备产气荚膜梭菌菌悬液,将其置于干式恒温器上100℃加热20min,然后于12000r/min离心10min,取上清液分装Eppendorf管,作为扩增反应的DNA粗制模板,溶解于50μL的TE溶液中。
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