[发明专利]针对先天性甲减的靶向二代测序的基因芯片

说明书

本发明提供了一种针对先天性甲减(CH)疾病的靶向二代测序的基因芯片。具体地，本发明提供先天性甲减相关基因或其位点、和/或其检测试剂的用途，用于制备试剂或试剂盒，所述试剂或试剂盒用于：(a)检测被检测对象对CH的患病风险，(b)对CH患者进行分子诊断或分子分型，和/或(c)评估被检测对象后代对CH的患病风险；所述CH致病基因包括DUOX2、TG和TPO。本发明适用于临床拟诊外周性CH患者，尤其是中国CH患者，可高通量检测并临床推广，有助于对先天性甲减的分子诊断、分子分型、产前诊断以及指导患者的后续治疗，具有重要的临床价值。

技术领域

本发明涉及生物医药领域，具体地，涉及针对先天性甲减的靶向二代测序的基因突变诊断。

背景技术

随着我国新生儿疾病筛查的开展与普及，越来越多的新生儿被发现患有先天性甲减(CH)。在西方国家，先天性甲减的发病率约为1/3000—1/4000。而在我国自1981年开始进行新生儿先天性甲减的筛查，目前，全国筛查覆盖率已经超过60％，初步资料显示，新生儿先天性甲减的发病率约为1/2050。先天性甲减是小儿内分泌科最常见的内分泌代谢疾病，如果未及时治疗，会导致身材矮小，智力障碍，俗称“呆小症”，给家庭和社会造成严重的负担。

文献表明85％的先天性甲减是由甲状腺发育不全导致的，包括甲状腺异位，缺如或发育不全，与之相关的致病基因包括PAX8,NKX2-1,FOXE1,NKX2-5,HHEX和GNAS。另外15％的先天性甲减是由甲状腺激素合成障碍导致的，与之相关的致病基因包DUOX2,DUOXA2,DUOX1,DUOXA1,TPO,TG,SLC26A4,SLC5A5,IYD,DIO1,DIO2和TSHR等。另外极少先天性甲减是由甲状腺激素抵抗导致的，与之相关的致病基因包括THRA,THRB,SLC16A2。

肠道吸收的I-经血液循环，由钠碘同向转运体(NIS/Pendrin)进入甲状腺滤泡上皮细胞，再通过Anoctamin-1从滤泡细胞的顶膜转运到滤泡腔中。I-在甲状腺过氧化物酶(thyroid peroxidase,TPO)的作用下被活化，活化后的I-参与酪氨酸的碘化，生成一碘酪氨酸(MIT)和二碘酪氨酸(DIT)。一个分子的MIT与一个分子的DIT发生耦联，形成三碘甲腺原氨酸(T3)，而两分子的DIT发生偶联，就可以生成甲状腺素(T4)。在碘的活化、酪氨酸残基碘化及碘化酪氨酸的耦联过程中均需要甲状腺过氧化物酶的催化作用。而甲状腺过氧化物酶需要在过氧化氢(hydrogen peroxide,H₂O₂)的作用下才能发挥活性，促进碘化或偶联。而H₂O₂是在双氧化酶2(dual oxidase 2,DUOX2)或双氧化酶成熟因子2(dual oxidasematuration factor 2,DUOXA2)共同作用下生成的。所有编码这些蛋白的基因突变都会导致不同程度的甲状腺激素合成障碍。

近年来，有越来越多的文献报道对先天性甲减的致病基因的研究，到目前为止，大约有20多个基因突变被报道可以导致先天性甲减的发生，但以往对这类疾病的分子诊往往仅局限于一个或少数几个基因，采用候选基因Sanger测序的方法，费时费力，而且有时不能得到明确结果。

综上所述，建立一种基于二代测序技术的靶向基因测序对于CH疾病的分子诊断具有重要的价值和意义，有望大幅度改善患者的预后。因此，本领域迫切需要开发一种针对先天性甲减的靶向二代测序的致病基因突变筛查的分子诊断方法。

发明内容

本发明的目的在于提供一种针对先天性甲减的靶向二代测序的致病基因突变筛查的分子诊断方法。

本发明的另一目的是为了提供一种针对先天性甲减患者的靶向基因二代测序的检测方法。

本发明的第一方面，提供了一种先天性甲减致病基因或其位点、和/或其检测试剂的用途，用于制备试剂或试剂盒，所述试剂或试剂盒用于：

(a)检测被检测对象对先天性甲减的患病风险，