[发明专利]用于生物芯片检测金黄色葡萄球菌的探针组序列

说明书

本发明公开了一种用于生物芯片检测金黄色葡萄球菌的探针组序列，属于食源性致病微生物检测技术领域。所述的探针组为：捕获探针CP(CP，Capture probe)、检测探针(DP，detect probe)、滚环探针(RCP，Rolling circle probe)。该套探针组序列根据GenBank上金黄色葡萄球菌的全基因组序列设计，以上述探针组开发的生物芯片RCA检测金黄色葡萄球菌方法具有灵敏度高、特异性强和准确性高等特点，可广泛适用于食品、养殖及口岸等检测。

技术领域

本发明属于食源性致病微生物检测技术领域，涉及检测金黄色葡萄球菌探针序列，具体涉及一种用于生物芯片检测金黄色葡萄球菌的探针组序列。

背景技术

金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是人类的一种重要病原菌，隶属于葡萄球菌属(Staphylococcus)，有“嗜肉菌的别称，在自然界中无处不在，空气、水、灰尘及人和动物的排泄物中都可找到。因此，食品受到污染的机会很多，美国疾病控制中心报告，由金黄色葡萄球菌引起的感染占第二位，仅次于大肠杆菌。金黄色葡萄球菌肠毒素引起的食物中毒，占整个细菌性食物中毒的33％，中国金黄色葡萄球菌引起的食物中毒事件也时有发生，中毒食品种类多，如奶、肉、蛋、鱼及其制品。金黄色葡萄球菌是人类化脓感染中最常见的病原菌，可引起局部化脓感染，也可引起肺炎、伪膜性肠炎、心包炎等，甚至败血症、脓毒症等全身感染。金黄色葡萄球菌为侵袭性细菌，能产生毒素，对肠道破坏性大，所以金黄色葡萄球菌肠炎起病急，中毒症状严重，主要表现为呕吐、发热、腹泻。呕吐常在发热前出现，发热很高。

金黄色葡萄球菌对食品安全以及人类自身健康已构成了不容忽视的威胁。传统的检测方法包括增菌培养筛选及后续计数检测、生化反应鉴定或血清学鉴定等环节，这些传统方法仍然是目前食品卫生监管机构的主流检测方法。然而随着检验要求的提升和检验规模的扩大，传统方法的缺点也日益凸显，如检测周期长，准备和收尾工作繁重、特异性不足、灵敏度低，而且需要专业操作人员等。再加上实际检测中，大部分食品微生物检测的结果为阴性，而生物芯片技术为金黄色葡萄球菌的检测提供了良好的技术平台。因此运用生物芯片检测方法对大量样本进行检测，可大大提高食品微生物检验的执行效率。但是应用生物芯片进行金黄色葡萄球菌菌的检测就必须获得大量的特异性探针，大量的种质特异性探针是生物芯片检测技术的关键。

发明内容

发明目的：为了克服现有技术中存在的不足，本发明提供一种用于生物芯片检测金黄色葡萄球菌的探针组序列。

技术方案：为实现上述目的，本发明采用的技术方案为：

一种用于生物芯片检测金黄色葡萄球菌的探针组序列，每个探针组均包括捕获探针CP、检测探针DP、滚环探针RCP，其中，所述DP由DP-A、DP-B和DP-C三部分依次连接组成；所述RCP为共用探针。

进一步的，捕获探针CP、检测探针DP共有4组，序列分别如下：

CP1如5′-NH₂-SEQ ID NO：1-3′所示，DP1如5′-SEQ ID NO：2～4-3′所示，其中，DP1-A如SEQ ID NO：2所示，DP1-B如SEQ ID NO：3所示，DP1-C如SEQ ID NO：4所示；

CP2如5′-NH₂-SEQ ID NO：5-3′所示，DP2如5′-SEQ ID NO：6～8-3′所示，其中，DP2-A如SEQ ID NO：6所示，DP2-B如SEQ ID NO：7所示，DP2-C如SEQ ID NO：8所示；

CP3如5′-NH₂-SEQ ID NO：9-3′所示，DP3如5′-SEQ ID NO：10～12-3′所示，其中，DP3-A如SEQ ID NO：10所示，DP3-B如SEQ ID NO：11所示，DP3-C如SEQ ID NO：12所示；