[发明专利]一种高产羟基四氢嘧啶的基因工程菌及其构建方法与应用在审

专利信息
申请号: 201810232232.8 申请日: 2018-03-21
公开(公告)号: CN108441460A 公开(公告)日: 2018-08-24
发明(设计)人: 谢希贤;王宁;马倩;陈宁;范晓光;刘旭峰;徐庆阳;张成林;李燕军 申请(专利权)人: 天津科技大学
主分类号: C12N1/21 分类号: C12N1/21;C12N15/70;C12N15/90;C12P17/12;C12R1/19
代理公司: 天津市三利专利商标代理有限公司 12107 代理人: 李蕊
地址: 天津市河*** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 羟基四氢嘧啶 整合 基因工程菌 强启动子 构建 合成酶 高丝氨酸脱氢酶I 大肠杆菌基因组 谷氨酸棒状杆菌 琥珀酰辅酶A 高产 发酵法生产 木糖启动子 合成途径 四氢嘧啶 盐单胞菌 基因 基因簇 羟化酶 伸长 菌株 位点 重构 应用
【权利要求书】:

1.一种高产羟基四氢嘧啶的基因工程菌,命名为E.coli HECT06,是以大肠杆菌为出发菌株,在其基因组上做如下改造而得到的:在大肠杆菌基因组上整合了由木糖启动子PxylF控制的来源于T7噬菌体的RNA聚合酶T7RNAP;敲除了编码高丝氨酸脱氢酶I的thrA基因,阻止L-天冬氨酸-β-半醛向分支代谢产物苏氨酸、赖氨酸、蛋氨酸的支路代谢;通过整合来源于谷氨酸棒状杆菌的lysC基因,由强启动子PT7启动,解除赖氨酸对四氢嘧啶合成途径中的关键酶天冬氨酸激酶Ask的反馈抑制;整合来源于伸长盐单胞菌Halomonas elongate的ectABC基因簇以及编码四氢嘧啶羟化酶的ectD基因,并由强启动子PT7启动,重构了羟基四氢嘧啶合成途径;在琥珀酰辅酶A合成酶sucCD位点整合了ectD基因,由强启动子PT7启动。

2.根据权利要求1所述的高产羟基四氢嘧啶的基因工程菌,其特征在于:所述大肠杆菌为E.coli W3110,保藏号ATCC 27325。

3.根据权利要求1所述的高产羟基四氢嘧啶的基因工程菌,其特征在于:所述木糖启动子PxylF具有序列表1所示核苷酸序列;所述RNA聚合酶T7RNAP具有序列表2所示核苷酸序列;所述thrA基因具有序列表3所示核苷酸序列;所述lysC基因具有序列表4所示核苷酸序列;所述强启动子PT7具有序列表5所示核苷酸序列;所述ectABC基因簇来源于H.elongata,保藏号CGMCC No.1.6329;所述ectABC基因簇具有序列表6所示核苷酸序列;所述编码四氢嘧啶羟化酶的ectD基因来源于H.elongata,保藏号CGMCC No.1.6329;所述ectD基因具有序列表7所示核苷酸序列。

4.权利要求1所述高产羟基四氢嘧啶的基因工程菌的构建方法,其特征在于:采用CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术对E.coli W3110进行定向改造,具体步骤如下:

(1)在大肠杆菌基因组上,将来源于T7噬菌体的RNA聚合酶T7RNAP基因整合在lacZ基因位点;

(2)为了减弱天冬氨酸支路代谢,将编码高丝氨酸脱氢酶I的thrA基因敲除;

(3)为增加前体物天冬氨酸半醛的供应,将来源于谷氨酸棒状杆菌的编码天冬氨酸激酶的lysC基因整合在yghX基因位点;

(4)将四氢嘧啶合成基因簇ectABC整合到ybeM基因位点,重构四氢嘧啶合成途径;

(5)将四氢嘧啶羟化酶基因ectD整合到trpR基因位点,重构羟基四氢嘧啶合成途径;

(6)为增加α-酮戊二酸量以提高EctD酶活,将ectD基因整合在编码琥珀酰辅酶A合成酶的sucCD基因位点。

5.权利要求1所述基因工程菌在发酵生产羟基四氢嘧啶方面的应用。

6.根据权利要求5所述基因工程菌的应用,其特征在于:具体方法为:

摇瓶发酵:

将菌种活化后制备种子液,按10-15%接种量接种到三角瓶中(终体积为30mL),九层纱布封口,37℃,200r/min振荡培养,发酵过程中通过补加氨水维持pH在7.0-7.2;补加60%(m/v)葡萄糖溶液维持发酵进行,发酵液颜色不再变化时即视为缺糖,缺糖时补加1-2mL60%(m/v)葡萄糖溶液,发酵初始添加60%(m/v)木糖溶液诱导目的基因表达,发酵周期22-26h;或

发酵罐发酵:

将菌种活化后制备种子液,按照15-20%接种量接入新鲜的发酵培养基,开始发酵,发酵过程中控制pH稳定在7.0左右,温度维持在37℃,溶氧在30-40%;当培养基中的葡萄糖消耗完之后,流加80%(m/v)的葡萄糖溶液,维持发酵培养基中的葡萄糖浓度在0.1-5g/L;发酵周期36-40h。

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