[发明专利]蓝舌病病毒基因型分型鉴别的多重RT-PCR试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201810247837.4 | 申请日: | 2018-03-23 |
公开(公告)号: | CN108384889B | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 聂福平;王昱;黄秋华;王国民;杨俊;李贤良 | 申请(专利权)人: | 重庆海关技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686 |
代理公司: | 重庆市恒信知识产权代理有限公司 50102 | 代理人: | 李金蓉 |
地址: | 400020*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蓝舌病 病毒 基因型 鉴别 多重 rt pcr 试剂盒 及其 检测 方法 | ||
1.蓝舌病病毒2型、3型、4型、7型、12型基因型分型鉴别的多重RT-PCR试剂盒,其特征是:包括各型反转录引物管、Mix PCR反应液管、阳性对照管、阴性对照管和灭菌去离子水管;
所述各型反转录引物管如下:
蓝舌病病毒2型反转录引物管:DNA序列为SEQ ID NO.2 的蓝舌病病毒2型下游引物0.5OD;
蓝舌病病毒3型反转录引物管:DNA序列为SEQ ID NO.4 的蓝舌病病毒3型下游引物0.5OD;
蓝舌病病毒4型反转录引物管:DNA序列为SEQ ID NO.6 的蓝舌病病毒4型下游引物0.5OD;
蓝舌病病毒7型反转录引物管:DNA序列为SEQ ID NO.8 的蓝舌病病毒7型下游引物0.5OD;
蓝舌病病毒12型反转录引物管:DNA序列为SEQ ID NO.10的蓝舌病病毒12型下游引物0.5OD;
所述Mix PCR反应液管由以下反应液组成:
DNA序列为SEQ ID NO.11的100μmol/L的通用上游引物0.75μL;
DNA序列为SEQ ID NO.12的100μmol/L的通用下游引物0.75μL;
DNA序列为SEQ ID NO.13的10μmol/L的蓝舌病病毒2型特异性嵌合上游引物0.4μL;
DNA序列为SEQ ID NO.14的10μmol/L的蓝舌病病毒2型特异性嵌合下游引物0.4μL;
DNA序列为SEQ ID NO.15的10μmol/L的蓝舌病病毒3型特异性嵌合上游引物0.5μL;
DNA序列为SEQ ID NO.16的10μmol/L的蓝舌病病毒3型特异性嵌合下游引物0.5μL;
DNA序列为SEQ ID NO.17的10μmol/L的蓝舌病病毒4型特异性嵌合上游引物0.35μL;
DNA序列为SEQ ID NO.18的10μmol/L的蓝舌病病毒4型特异性嵌合下游引物0.35μL;
DNA序列为SEQ ID NO.19的10μmol/L的蓝舌病病毒7型特异性嵌合上游引物0.35μL;
DNA序列为SEQ ID NO.20的10μmol/L的蓝舌病病毒7型特异性嵌合下游引物0.35μL;
DNA序列为SEQ ID NO.21的10μmol/L的蓝舌病病毒12型特异性嵌合上游引物0.35μL;
DNA序列为SEQ ID NO.22的10μmol/L的蓝舌病病毒12型特异性嵌合下游引物0.35μL;
2X Premix Taq 缓冲液 12.5μL;
灭菌去离子水2.1μL;
合计20μL,为单次反应的用量;
所述阳性对照管:管内为蓝舌病病毒2型、蓝舌病病毒3型、蓝舌病病毒4型、蓝舌病病毒7型、蓝舌病病毒12型阳性重组质粒混合物;
所述阴性对照管:管内为无蓝舌病病毒2型、蓝舌病病毒3型、蓝舌病病毒4型、蓝舌病病毒7型、蓝舌病病毒12型的牛肉肌肉组织DNA样品;
所述灭菌去离子水管:1000μL。
2.根据权利要求1所述蓝舌病病毒2型、3型、4型、7型、12型基因型分型鉴别的多重RT-PCR试剂盒,其特征是:所述阳性重组质粒由如下步骤获得:分别以如下DNA序列引物组:SEQID NO.1和SEQ ID NO.2,SEQ ID NO.3 和SEQ ID NO.4,SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6,SEQID NO.7和SEQ ID NO.8,SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10,按常规RT-PCR扩增,分别将PCR目的产物与PMD19-T载体进行连接,转化到DH5α后扩大培养提取质粒,并PCR鉴定、测序和NCBI-BLAST比对获得。
3.根据权利要求1所述蓝舌病病毒 2型、3型、4型、7型、12型基因型分型鉴别的多重RT-PCR试剂盒,其特征是:蓝舌病病毒2型、蓝舌病病毒3型、蓝舌病病毒4型、蓝舌病病毒7型、蓝舌病病毒12型在同一PCR反应管中进行特异性扩增,根据扩增片段的大小,鉴别区分蓝舌病病毒2型、蓝舌病病毒3型、蓝舌病病毒4型、蓝舌病病毒7型和蓝舌病病毒12型的5种基因型。
4.利用权利要求1到3任一项所述试剂盒进行蓝舌病病毒2型、蓝舌病病毒3型、蓝舌病病毒4型、蓝舌病病毒7型和蓝舌病病毒12型的多重RT-PCR非疾病诊断目的的检测方法:包括如下步骤:
(1)待测样品cDNA模板制备:按照商品化病毒RNA提取试剂盒提取待测
样品全基因组,分别用各型反转录引物及商品化反转录试剂盒使用说明书,制备待测样品cDNA,取等量混匀置于-20℃备用;
(2)PCR扩增反应体系:20μL Mix PCR反应液,5μL待测样品cDNA模板或阳性对照或阴性对照,反应总体积为25μL;
(3)PCR扩增反应条件:95℃ 5min;95℃ 30s,57℃退火30s,72℃ 30s,10个循环;95℃30s,50℃ 30s,72℃ 30s,25个循环;72℃ 5min,4℃保存;
(4)结果判定:在Qesp100进行毛细管电泳后,阳性对照出现5个吸收峰分别为蓝舌病病毒7型在150-161bp间,蓝舌病病毒4型在208-222bp之间,蓝舌病病毒12型在242-258bp之间,蓝舌病病毒2型在281-301bp之间,蓝舌病病毒3型在408-435bp之间,阴性对照无吸收峰;样品在阳性对照位置相同的位置出现吸收峰则判定为该基因型阳性,无吸收峰出现则判定为该基因型阴性;阳性质控未出现目的条带或阴性对照出现条带,则结果无效。
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