[发明专利]一种真菌RNA干涉载体pBHt2-CHSA Intron、构建方法及应用有效

专利信息
申请号: 201810267753.7 申请日: 2018-03-29
公开(公告)号: CN108486143B 公开(公告)日: 2021-09-03
发明(设计)人: 刘文轩;夏晴;董振杰;麦艳娜;马超;李欢欢 申请(专利权)人: 河南农业大学
主分类号: C12N15/80 分类号: C12N15/80;C12N15/66;C12N1/15;C12R1/645
代理公司: 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) 61223 代理人: 俞晓明
地址: 450002*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 一种 真菌 rna 干涉 载体 pbht2 chsa intron 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.真菌RNA干涉载体pBHt2-CHSA-Intron-Gdo在小麦全蚀菌龙胆酸加双氧酶基因(Gdo)RNAi效应分析中的应用,其特征在于,所述载体能够抑制全蚀病菌的生长发育;

所述的真菌RNA干涉载体pBHt2-CHSA-Intron-Gdo的构建方法包括以下步骤:

S1,去除pBHt2质粒的eGFP序列,构建pBHt2线性载体

S11,pBHt2-eGFP载体用BsrG1和SacI双酶切,切除9782-710bp位置的DNA片段,切除的DNA片段核苷酸序列如SEQ ID NO. 2所示, 凝胶回收余下9072bp的酶切片段;

S12,人工合成一段如SEQ ID NO. 3所示的序列;

S13,人工合成的SEQ ID NO. 3所示片段用SacI酶切,凝胶回收75bp的SacI酶切片段;将9072bp的酶切片段与75bp的SacI酶切片段用T4 DNA连接酶连接;连接后的质粒跑凝胶电泳回收,得到大小为9147bp的pBHt2线性载体;

S2,制备CHSA-Intron及两翼多克隆位点序列

pFGC5941质粒用NcoI和SmaI进行双酶切,其中NcoI酶切产生5’粘性末端,SmaI酶切产生平末端;凝胶回收1421 bp的CHSA-Intron线性片段;

S3,连接pBHt2线性载体与CHSA-Intron线性片段

将S13回收的pBHt2线性载体用NcoI酶切,然后与S2回收的CHSA-Intron线性片段用T4DNA ligase连接;连接产物跑凝胶电泳,回收产物用连接酶进行平末端连接;连接产物跑胶纯化,回收重组质粒,即新载体候选质粒;新载体候选质粒经克隆鉴定,片段大小正确的为真菌RNA干涉载体pBHt2-CHSA Intron,如SEQ ID NO. 1所示;

S4,构建pBHt2-CHSA-Intron-Gdo载体

以全蚀病菌cDNA为模板,用引物PCR扩增出龙胆酸加双氧酶基因(Gdo)片段,所述引物序列如下:

5'引物序列:

5'-CAAACCATGGGGCGCGCCATGCTGGTGAACCCATCTCG-3',如SEQ ID NO. 4所示,

3'引物序列:

5'-AAATTCTTACACATTTAAATAGGTAGGGCAGAGTGGCATA-3',如SEQ ID NO. 5所示;

将所述干扰载体pBHt2-CHSA-Intron经过酶AscI和SwaI双酶切线性化后,通过无缝连接方法将Gdo片段连接到CHSA Intron的上游;然后用BamHI/XbaI双酶切载体,将Gdo片段反向连接,最终把Gdo序列相同的两段片段接入干扰载体pBHt2-CHSA-Intron上,构建出pBHt2-CHSA-Intron-Gdo载体。

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